74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0836 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  64.97 
 
 		 180 aa  238  5e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  64.77 
 
 		 179 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  64.41 
 
 		 180 aa  237  5.999999999999999e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  64.77 
 
 		 179 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  64.41 
 
 		 180 aa  236  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  64.2 
 
 		 179 aa  236  2e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  63.64 
 
 		 179 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  64.16 
 
 		 176 aa  229  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  62.5 
 
 		 176 aa  227  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  64.41 
 
 		 180 aa  201  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  60.12 
 
 		 178 aa  197  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  36 
 
 		 183 aa  97.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  30.37 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  31.11 
 
 		 177 aa  58.2  0.00000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  28.1 
 
 		 514 aa  54.3  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  37.84 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  30.16 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  30.34 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  26.17 
 
 		 480 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  25.95 
 
 		 522 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  25.48 
 
 		 513 aa  48.5  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  27.05 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 		 493 aa  48.1  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.48 
 
 		 549 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  27.86 
 
 		 555 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 579 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  31.58 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  30.53 
 
 		 158 aa  47  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  38.89 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  29.27 
 
 		 501 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  31.17 
 
 		 575 aa  45.8  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  25.49 
 
 		 207 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 486 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  24.41 
 
 		 189 aa  44.7  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  30.12 
 
 		 163 aa  44.7  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  31.53 
 
 		 161 aa  44.7  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  25.96 
 
 		 166 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  28.83 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  27.47 
 
 		 539 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  28.83 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  32.53 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  29.36 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  30.95 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  27.89 
 
 		 609 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  29.82 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  31.31 
 
 		 247 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  37.04 
 
 		 179 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  28.44 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  28.44 
 
 		 158 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  27.93 
 
 		 158 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  30.53 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  27.93 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  27.93 
 
 		 158 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  27.93 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  28.4 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  27.93 
 
 		 158 aa  42.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  32.79 
 
 		 176 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  35.56 
 
 		 512 aa  42  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  27.63 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  27.63 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  27.63 
 
 		 165 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  27.84 
 
 		 492 aa  41.2  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  25.93 
 
 		 169 aa  40.8  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  29.51 
 
 		 551 aa  41.2  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  25.77 
 
 		 177 aa  41.2  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  22.83 
 
 		 495 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>