61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1940 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  53.9 
 
 		 177 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  34.41 
 
 		 192 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  32.28 
 
 		 549 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  32.2 
 
 		 486 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  31.58 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  34.34 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  31.48 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  31.58 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  30.51 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  29.73 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  24.26 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  36.49 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  27.12 
 
 		 242 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  28.77 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  27.1 
 
 		 165 aa  52.8  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  31.07 
 
 		 169 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  29.1 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  32.53 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  35.11 
 
 		 646 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28 
 
 		 512 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  33.61 
 
 		 493 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  32.86 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  31.54 
 
 		 501 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  30.53 
 
 		 550 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  33.63 
 
 		 242 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  28.32 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  28.68 
 
 		 507 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  30.91 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  32.88 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  31.71 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  36.79 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  27.68 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  30.69 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  33.75 
 
 		 165 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  32.99 
 
 		 547 aa  45.1  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 165 aa  44.7  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  28.24 
 
 		 658 aa  44.7  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  30.12 
 
 		 467 aa  44.3  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  27.91 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  28.87 
 
 		 516 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  44.3  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  32.26 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  41.67 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  31.18 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  27.85 
 
 		 160 aa  43.1  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.18 
 
 		 579 aa  42.4  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  34.43 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  30 
 
 		 609 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  35.71 
 
 		 150 aa  42  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  40.43 
 
 		 171 aa  41.6  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 		 494 aa  41.2  0.01  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  39.58 
 
 		 165 aa  41.2  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>