133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2099 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  63.29 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  56.33 
 
 		 167 aa  164  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  59.12 
 
 		 174 aa  155  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  57.5 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  56.33 
 
 		 183 aa  150  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  50 
 
 		 170 aa  150  7e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  47.62 
 
 		 167 aa  132  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  49.09 
 
 		 161 aa  127  6e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  48.39 
 
 		 182 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  56.9 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  47.34 
 
 		 171 aa  120  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  47.1 
 
 		 182 aa  117  7e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  47.9 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  41.67 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  40.61 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  94.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  37.82 
 
 		 188 aa  86.7  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  51.16 
 
 		 148 aa  84  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  33.03 
 
 		 176 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  36.36 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  36.63 
 
 		 170 aa  57.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  33.88 
 
 		 161 aa  58.2  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  29.2 
 
 		 242 aa  57.4  0.00000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  40.28 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  38.27 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  34.38 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  32.5 
 
 		 165 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  39.44 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  39.44 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  29.7 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  32.3 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  36.9 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  27.36 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  28.48 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  35.35 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  32.53 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  43.1 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  32.73 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  33.64 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  41.89 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  31.78 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  31.82 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  31.82 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  31.82 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  31.82 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  34.38 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  31.82 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  40.79 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  29.25 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  54.3  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  29.07 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  31.82 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  26.42 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  25.49 
 
 		 162 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  40.28 
 
 		 555 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  36.47 
 
 		 491 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  39.74 
 
 		 558 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  29.79 
 
 		 242 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  32.65 
 
 		 164 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 		 646 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  34.07 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  33.64 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  40.79 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  31.15 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  39.73 
 
 		 193 aa  51.2  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  30.82 
 
 		 530 aa  50.8  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  26 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  37.84 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  28.77 
 
 		 575 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  45.28 
 
 		 551 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  33.91 
 
 		 182 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  29.38 
 
 		 609 aa  49.7  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  35.64 
 
 		 196 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  35.62 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  45.28 
 
 		 521 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  33.64 
 
 		 181 aa  47.8  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  35.94 
 
 		 174 aa  47.8  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  27.59 
 
 		 486 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  25.81 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  32.81 
 
 		 550 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.16 
 
 		 547 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  26.35 
 
 		 504 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  32.58 
 
 		 164 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  26.35 
 
 		 579 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  32 
 
 		 177 aa  45.1  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  29.82 
 
 		 512 aa  45.1  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  35.23 
 
 		 549 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  40.62 
 
 		 160 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>