123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3352 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 504 aa  1022    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  55.56 
 
 		 513 aa  598  1e-170  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  51.75 
 
 		 514 aa  568  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  48.47 
 
 		 522 aa  499  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  45.29 
 
 		 541 aa  455  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  43.44 
 
 		 492 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  26.63 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  25.92 
 
 		 504 aa  146  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  24.03 
 
 		 501 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  25.28 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  25.06 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  22.9 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.06 
 
 		 512 aa  92.8  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  24.08 
 
 		 472 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  24.08 
 
 		 472 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  25.17 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  24.16 
 
 		 472 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.94 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  24.71 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  23.61 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.84 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  23.8 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  23.56 
 
 		 453 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.17 
 
 		 486 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  20.67 
 
 		 479 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  23.61 
 
 		 575 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.22 
 
 		 493 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  20.53 
 
 		 486 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.09 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.32 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.98 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  21.4 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.06 
 
 		 474 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  32.52 
 
 		 449 aa  68.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.22 
 
 		 474 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.74 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  21.61 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  19.73 
 
 		 480 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  20.67 
 
 		 632 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  20.9 
 
 		 491 aa  63.2  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  20.64 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  22.61 
 
 		 487 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.43 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  20.85 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  21.74 
 
 		 549 aa  58.9  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  40.74 
 
 		 533 aa  58.2  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  21.16 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  27.54 
 
 		 587 aa  57  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  22.46 
 
 		 501 aa  57  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  20.92 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  22.61 
 
 		 504 aa  56.2  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  23.75 
 
 		 646 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  20.72 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  21.96 
 
 		 540 aa  53.9  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  24.23 
 
 		 506 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  29.59 
 
 		 203 aa  53.5  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  20.96 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  27.78 
 
 		 508 aa  52.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  21.08 
 
 		 634 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  28.74 
 
 		 555 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  23.76 
 
 		 555 aa  52.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  30.39 
 
 		 530 aa  51.6  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  20.59 
 
 		 469 aa  52  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  23.77 
 
 		 152 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  25.55 
 
 		 176 aa  51.2  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  27.55 
 
 		 163 aa  51.6  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  26.4 
 
 		 176 aa  50.1  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  19.64 
 
 		 609 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  21.83 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 673 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  31.43 
 
 		 180 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  24.81 
 
 		 521 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  23.94 
 
 		 192 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  20.94 
 
 		 377 aa  48.1  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  30.77 
 
 		 766 aa  48.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  23.84 
 
 		 180 aa  47.8  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  27.85 
 
 		 174 aa  47.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  33.33 
 
 		 166 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  22.4 
 
 		 511 aa  47.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  24 
 
 		 507 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  47  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 		 159 aa  47.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  28.1 
 
 		 179 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  28.1 
 
 		 179 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 		 173 aa  47  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  28.1 
 
 		 179 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  27.55 
 
 		 169 aa  47  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  28.1 
 
 		 179 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  29.21 
 
 		 180 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  22.22 
 
 		 165 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  29.81 
 
 		 158 aa  46.6  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>