88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2490 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  884    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  44.33 
 
 
476 aa  294  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  44.37 
 
 
489 aa  292  1e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  34.97 
 
 
443 aa  200  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  32.38 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  33.18 
 
 
530 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  31.92 
 
 
575 aa  163  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  31.96 
 
 
521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  31.76 
 
 
491 aa  152  8e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  28.96 
 
 
551 aa  147  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  28.42 
 
 
555 aa  140  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  31.3 
 
 
483 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  29.12 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  29.15 
 
 
555 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  28.76 
 
 
766 aa  113  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.87 
 
 
486 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.88 
 
 
493 aa  95.9  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.86 
 
 
632 aa  92.8  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  26.95 
 
 
467 aa  92  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  27.4 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  25.47 
 
 
579 aa  84.3  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  25.49 
 
 
549 aa  84  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.96 
 
 
512 aa  80.9  0.00000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  24.62 
 
 
513 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  30.84 
 
 
558 aa  76.6  0.0000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.69 
 
 
480 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  28.16 
 
 
646 aa  75.5  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  26.89 
 
 
501 aa  70.5  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.67 
 
 
486 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  21.47 
 
 
541 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.38 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  27.25 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  32.52 
 
 
504 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  27.14 
 
 
575 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.93 
 
 
483 aa  68.6  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  20.12 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20 
 
 
476 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.28 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  19.88 
 
 
480 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  32 
 
 
522 aa  66.6  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  27.11 
 
 
554 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.06 
 
 
474 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  19.63 
 
 
486 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  26.77 
 
 
540 aa  63.9  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  29.27 
 
 
587 aa  63.9  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.06 
 
 
474 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  27.86 
 
 
498 aa  62.4  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  26.04 
 
 
643 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  28.7 
 
 
514 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  25 
 
 
550 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  26.5 
 
 
532 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  26.71 
 
 
508 aa  58.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  31.17 
 
 
547 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  25.42 
 
 
554 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  22.48 
 
 
471 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.09 
 
 
453 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  25.53 
 
 
609 aa  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  25.13 
 
 
504 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  21.95 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  28.42 
 
 
673 aa  50.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  30.71 
 
 
171 aa  50.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  35.35 
 
 
494 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  26.88 
 
 
542 aa  50.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  25.81 
 
 
152 aa  50.4  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  26.19 
 
 
527 aa  50.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  21.69 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  23.59 
 
 
634 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  27.57 
 
 
491 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  21.54 
 
 
472 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  24.07 
 
 
506 aa  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  20.73 
 
 
472 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  20.73 
 
 
472 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  39.53 
 
 
174 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  25.4 
 
 
492 aa  47.8  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  21.14 
 
 
472 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  21.14 
 
 
472 aa  47.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  21.62 
 
 
472 aa  47.4  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  22.47 
 
 
166 aa  46.6  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  24.22 
 
 
183 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.83 
 
 
170 aa  45.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  27.91 
 
 
179 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  27.96 
 
 
619 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20.33 
 
 
472 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  26.87 
 
 
242 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  20 
 
 
169 aa  44.3  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  32.1 
 
 
183 aa  43.9  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  29.05 
 
 
487 aa  43.9  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  35.87 
 
 
161 aa  43.9  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>