175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2115 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 494 aa  974    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  29.76 
 
 		 547 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  32.53 
 
 		 575 aa  169  9e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  29.01 
 
 		 632 aa  164  3e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  29.52 
 
 		 486 aa  160  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.59 
 
 		 549 aa  136  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  28.82 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.09 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  28.78 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  25.79 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  24.89 
 
 		 493 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  28.04 
 
 		 646 aa  104  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  25.54 
 
 		 472 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  25.54 
 
 		 472 aa  103  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  25.22 
 
 		 504 aa  100  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  23.36 
 
 		 472 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  23.68 
 
 		 472 aa  99.8  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  24.89 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  23.93 
 
 		 472 aa  99  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  25.32 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  23.65 
 
 		 476 aa  97.4  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  26.79 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  24.38 
 
 		 530 aa  93.2  8e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  25.56 
 
 		 480 aa  93.6  8e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 		 504 aa  92.4  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  24.65 
 
 		 521 aa  92.4  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  38.73 
 
 		 579 aa  89.4  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  22.54 
 
 		 471 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  24.57 
 
 		 514 aa  87.4  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  26.51 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  24.61 
 
 		 513 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  21.8 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.85 
 
 		 486 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  24.13 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 		 489 aa  83.2  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  22.66 
 
 		 486 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  26.65 
 
 		 533 aa  83.2  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  24.05 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  24.82 
 
 		 609 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  24.74 
 
 		 483 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  25.24 
 
 		 555 aa  82  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.12 
 
 		 453 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  23.2 
 
 		 575 aa  81.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  24.28 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.6 
 
 		 479 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  25.69 
 
 		 449 aa  81.3  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.62 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.09 
 
 		 474 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  23.44 
 
 		 542 aa  77.8  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  23.3 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  24.61 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  27.98 
 
 		 532 aa  76.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.96 
 
 		 474 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.45 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  22.56 
 
 		 551 aa  74.3  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.45 
 
 		 470 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  26.85 
 
 		 516 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  25.65 
 
 		 491 aa  72.4  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  24.15 
 
 		 619 aa  71.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  25.4 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  24.42 
 
 		 540 aa  70.1  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  20.77 
 
 		 501 aa  68.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  27.05 
 
 		 487 aa  67  0.0000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  26.33 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  25.59 
 
 		 554 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  18.99 
 
 		 495 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  26.1 
 
 		 480 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  25.92 
 
 		 501 aa  64.7  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  26.4 
 
 		 558 aa  62.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  24.33 
 
 		 486 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  32.67 
 
 		 152 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  25.05 
 
 		 504 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  19.71 
 
 		 527 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  19.71 
 
 		 527 aa  62  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  30.72 
 
 		 195 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  36.96 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  23.99 
 
 		 474 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  35.43 
 
 		 488 aa  58.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  18.81 
 
 		 506 aa  58.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  24.26 
 
 		 377 aa  57.4  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  31.54 
 
 		 169 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  18.81 
 
 		 542 aa  56.2  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  24.84 
 
 		 550 aa  56.6  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  23.74 
 
 		 486 aa  56.6  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  26.54 
 
 		 498 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  36.25 
 
 		 555 aa  55.1  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  23.77 
 
 		 643 aa  54.7  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  33.73 
 
 		 155 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  22.73 
 
 		 506 aa  54.3  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  23.27 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  39.51 
 
 		 673 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  33.57 
 
 		 171 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  29.92 
 
 		 176 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  31.51 
 
 		 180 aa  50.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  29.63 
 
 		 700 aa  50.8  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  30.58 
 
 		 192 aa  50.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  35.53 
 
 		 508 aa  50.4  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  50.4  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  30.82 
 
 		 170 aa  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  30.63 
 
 		 163 aa  50.1  0.00009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>