148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3257 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  83.98 
 
 
476 aa  687    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
489 aa  937    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  44.37 
 
 
449 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  35.75 
 
 
443 aa  202  9e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  40.51 
 
 
483 aa  199  6e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  36.62 
 
 
491 aa  197  4.0000000000000005e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  36.74 
 
 
469 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  35.01 
 
 
555 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  35.58 
 
 
530 aa  173  5.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  33.41 
 
 
521 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  34.84 
 
 
575 aa  172  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  32.09 
 
 
551 aa  166  6.9999999999999995e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  32.39 
 
 
561 aa  162  9e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  34.14 
 
 
766 aa  160  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  31.99 
 
 
539 aa  137  4e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  30.36 
 
 
549 aa  116  7.999999999999999e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  39.35 
 
 
555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  40.21 
 
 
558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.12 
 
 
486 aa  110  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  28.91 
 
 
632 aa  103  5e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  25.61 
 
 
467 aa  87  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.95 
 
 
493 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  33.14 
 
 
587 aa  81.6  0.00000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  29.31 
 
 
643 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  24.7 
 
 
540 aa  80.9  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  24.15 
 
 
513 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  27.31 
 
 
498 aa  76.6  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  22.03 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.3 
 
 
480 aa  76.3  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  27.55 
 
 
467 aa  75.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  28.11 
 
 
516 aa  75.1  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  23.83 
 
 
486 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  26.23 
 
 
554 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  24.01 
 
 
514 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  25.54 
 
 
609 aa  71.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  24.91 
 
 
476 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25.17 
 
 
494 aa  70.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  25.8 
 
 
501 aa  70.9  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  27.2 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  22.3 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  23.47 
 
 
474 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  30.11 
 
 
488 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  23.47 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  24.16 
 
 
486 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.25 
 
 
579 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 
646 aa  68.6  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  22.49 
 
 
522 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.15 
 
 
472 aa  67  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25.14 
 
 
575 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.81 
 
 
470 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  23.94 
 
 
472 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  26.98 
 
 
506 aa  65.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  30.43 
 
 
504 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.68 
 
 
471 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  22.57 
 
 
472 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  22.04 
 
 
480 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  22.18 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  26.74 
 
 
634 aa  62.4  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  23.05 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  22.18 
 
 
472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.61 
 
 
483 aa  60.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.05 
 
 
512 aa  60.8  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  21.88 
 
 
471 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  22.63 
 
 
472 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  23.32 
 
 
453 aa  60.1  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  22.39 
 
 
472 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  20.45 
 
 
541 aa  59.7  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  21.19 
 
 
504 aa  57.4  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  28.89 
 
 
480 aa  57  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  25.4 
 
 
547 aa  56.6  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  46.05 
 
 
186 aa  55.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  28.27 
 
 
195 aa  54.3  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  27.39 
 
 
507 aa  54.3  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  28.94 
 
 
550 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  23.86 
 
 
492 aa  53.9  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  36.92 
 
 
190 aa  53.5  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  27.61 
 
 
491 aa  53.5  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  25.25 
 
 
527 aa  52.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  19.88 
 
 
472 aa  52.4  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  35.51 
 
 
176 aa  52  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  39.8 
 
 
167 aa  52.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  19.33 
 
 
472 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  36.19 
 
 
508 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  24.52 
 
 
673 aa  51.2  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  43.28 
 
 
165 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  25.76 
 
 
532 aa  51.2  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  22.89 
 
 
542 aa  50.1  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  29.27 
 
 
114 aa  49.3  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  43.55 
 
 
700 aa  48.9  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  37.14 
 
 
179 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  35.06 
 
 
158 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  40 
 
 
170 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  46.05 
 
 
171 aa  48.5  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  34.67 
 
 
158 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  35.71 
 
 
180 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0624  membrane-flanked domain-containing protein  35.48 
 
 
312 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.614646  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  34.67 
 
 
158 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  34.29 
 
 
180 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  34.67 
 
 
158 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  43.55 
 
 
183 aa  47.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>