139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3031 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 476 aa  920    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  83 
 
 		 489 aa  712    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  43.88 
 
 		 449 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  34.47 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  35.93 
 
 		 491 aa  194  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  38.65 
 
 		 483 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  34.88 
 
 		 469 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  34.86 
 
 		 530 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  34.46 
 
 		 555 aa  171  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  33.72 
 
 		 521 aa  169  9e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  31.66 
 
 		 551 aa  162  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  34.69 
 
 		 766 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  34.07 
 
 		 575 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  30.72 
 
 		 561 aa  158  2e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  33.17 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  39.81 
 
 		 555 aa  114  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  39.79 
 
 		 558 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  29.16 
 
 		 549 aa  108  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.34 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  27.31 
 
 		 632 aa  101  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  25.43 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.26 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  33.53 
 
 		 587 aa  82  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  23.77 
 
 		 513 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  25.55 
 
 		 467 aa  77.8  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  24.33 
 
 		 486 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.19 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  23.31 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.35 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  23.19 
 
 		 514 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  27.06 
 
 		 501 aa  71.2  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  23.67 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  26.07 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  22.16 
 
 		 480 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  22.95 
 
 		 479 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25.18 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.57 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  30.56 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  26.52 
 
 		 554 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  27.98 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  28.07 
 
 		 516 aa  68.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  29.16 
 
 		 488 aa  67.4  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  29.57 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  27.17 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.99 
 
 		 470 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  24.29 
 
 		 575 aa  66.2  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  27.31 
 
 		 643 aa  66.6  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  30.5 
 
 		 646 aa  65.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  22.74 
 
 		 522 aa  65.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.8 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  22.3 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  21.9 
 
 		 541 aa  61.6  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  26.08 
 
 		 609 aa  61.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.35 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.54 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.74 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  34.88 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  20.97 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  20.97 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  21.74 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.22 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  26.87 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  21.81 
 
 		 471 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  27.22 
 
 		 532 aa  57  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  36.78 
 
 		 554 aa  56.6  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  31.25 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  46.05 
 
 		 186 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  20.54 
 
 		 483 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  20.7 
 
 		 515 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  27.86 
 
 		 550 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  35.24 
 
 		 508 aa  54.7  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  31.1 
 
 		 171 aa  54.3  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  20.73 
 
 		 504 aa  53.5  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  25.81 
 
 		 673 aa  53.5  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 		 480 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  23.74 
 
 		 527 aa  52.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  37.36 
 
 		 176 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  24.93 
 
 		 486 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  22.82 
 
 		 634 aa  51.2  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.07 
 
 		 195 aa  50.8  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  39.29 
 
 		 190 aa  50.8  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  22.12 
 
 		 542 aa  50.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  25.33 
 
 		 474 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  24.65 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  26.41 
 
 		 519 aa  50.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  37.14 
 
 		 179 aa  49.3  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  36.96 
 
 		 167 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  29.27 
 
 		 114 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  54.76 
 
 		 171 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  26.54 
 
 		 501 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  44.64 
 
 		 700 aa  48.5  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  44.64 
 
 		 165 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  38.64 
 
 		 174 aa  48.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  38.33 
 
 		 180 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0624  membrane-flanked domain-containing protein  35.48 
 
 		 312 aa  47.8  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.614646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  38.81 
 
 		 167 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  38.33 
 
 		 180 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  43.33 
 
 		 161 aa  47  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  36.51 
 
 		 165 aa  47  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  38.33 
 
 		 180 aa  47  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>