86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4977 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
539 aa  1046    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  52.4 
 
 
766 aa  368  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  43.38 
 
 
483 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  34.53 
 
 
443 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  33.17 
 
 
491 aa  169  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  33.67 
 
 
575 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.3 
 
 
530 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  31.19 
 
 
521 aa  161  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  35.69 
 
 
551 aa  153  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
476 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  33.5 
 
 
469 aa  144  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  32.05 
 
 
555 aa  142  9.999999999999999e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  33.16 
 
 
489 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  27.86 
 
 
561 aa  109  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  28.06 
 
 
449 aa  97.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  29.14 
 
 
632 aa  93.6  9e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  30.66 
 
 
558 aa  86.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  29.93 
 
 
555 aa  84.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.57 
 
 
549 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  28.29 
 
 
486 aa  73.9  0.000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  30.72 
 
 
532 aa  74.3  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  26.95 
 
 
480 aa  70.5  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  20.42 
 
 
501 aa  66.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  24.76 
 
 
483 aa  64.7  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  27.96 
 
 
554 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  33.72 
 
 
587 aa  61.6  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  30.6 
 
 
579 aa  60.8  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.13 
 
 
480 aa  60.5  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  24.92 
 
 
486 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  23.4 
 
 
547 aa  60.1  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  25.82 
 
 
467 aa  58.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 
486 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 
474 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  29.5 
 
 
504 aa  57.4  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  24.3 
 
 
554 aa  57  0.0000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  25.32 
 
 
506 aa  56.6  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  27.5 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  27.87 
 
 
516 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  24.25 
 
 
501 aa  54.7  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  30.23 
 
 
514 aa  53.9  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  22.76 
 
 
515 aa  53.9  0.000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 
646 aa  53.9  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.42 
 
 
476 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  26.89 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 
575 aa  51.2  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.26 
 
 
474 aa  51.2  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  29.55 
 
 
542 aa  50.1  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  34.38 
 
 
508 aa  50.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  19.93 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  19.75 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  20.14 
 
 
470 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  19.93 
 
 
474 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  21.79 
 
 
513 aa  49.3  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 
488 aa  48.5  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.51 
 
 
472 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  21.66 
 
 
471 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  36.23 
 
 
168 aa  48.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  26.98 
 
 
673 aa  48.1  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.43 
 
 
486 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.02 
 
 
453 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  23.49 
 
 
540 aa  47.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  30.95 
 
 
498 aa  47.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  34.52 
 
 
512 aa  47  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  23.45 
 
 
166 aa  47  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.82 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  20.24 
 
 
472 aa  47  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  25.74 
 
 
541 aa  46.6  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.22 
 
 
483 aa  47  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  22.52 
 
 
472 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  21.74 
 
 
472 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  32.91 
 
 
643 aa  46.2  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  21.74 
 
 
472 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.31 
 
 
480 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  28.09 
 
 
550 aa  45.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  28.24 
 
 
609 aa  45.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  21.59 
 
 
472 aa  45.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  20.14 
 
 
471 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  22.27 
 
 
472 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  31.2 
 
 
544 aa  44.7  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  28.7 
 
 
658 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  27.47 
 
 
179 aa  43.9  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  25.52 
 
 
634 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  28.3 
 
 
492 aa  43.9  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  35.04 
 
 
174 aa  43.9  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  24.24 
 
 
176 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  23.42 
 
 
114 aa  43.5  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>