85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6784 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  100 
 
 		 508 aa  971    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  44.84 
 
 		 643 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  42.94 
 
 		 554 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  47.28 
 
 		 532 aa  305  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  40.69 
 
 		 488 aa  236  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  36.53 
 
 		 609 aa  202  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  35.73 
 
 		 516 aa  201  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  38.1 
 
 		 491 aa  193  5e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  32.77 
 
 		 527 aa  171  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  33.19 
 
 		 519 aa  164  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  31.47 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  34.01 
 
 		 550 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  33.2 
 
 		 504 aa  147  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  30.21 
 
 		 634 aa  143  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  31.64 
 
 		 511 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  30.89 
 
 		 507 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  31.45 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  31.17 
 
 		 480 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  30.47 
 
 		 540 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  30.79 
 
 		 486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  31.2 
 
 		 486 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  31.2 
 
 		 474 aa  133  6e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  30.85 
 
 		 487 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  33.59 
 
 		 501 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  27.45 
 
 		 611 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  39.38 
 
 		 658 aa  110  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  25.81 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.28 
 
 		 493 aa  95.1  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  27.87 
 
 		 547 aa  94.7  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.09 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.2 
 
 		 474 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.59 
 
 		 470 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  22.63 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.22 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.13 
 
 		 471 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.56 
 
 		 480 aa  90.1  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.37 
 
 		 476 aa  87.4  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.77 
 
 		 474 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.21 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.74 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  27.2 
 
 		 632 aa  74.7  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.27 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  27.01 
 
 		 646 aa  68.2  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  28.88 
 
 		 449 aa  67  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  20.3 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  25.91 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  26.5 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  23.32 
 
 		 522 aa  66.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.57 
 
 		 513 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  26.59 
 
 		 443 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  22.13 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  23.23 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  27.48 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  19.61 
 
 		 541 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  30.73 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  30.1 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  26.77 
 
 		 575 aa  57.4  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  25.89 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.94 
 
 		 471 aa  55.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.98 
 
 		 453 aa  53.5  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  27.33 
 
 		 494 aa  53.5  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  33.64 
 
 		 539 aa  52.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  26.19 
 
 		 555 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  27.05 
 
 		 575 aa  49.3  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  25 
 
 		 177 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  28.57 
 
 		 492 aa  48.9  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  29.63 
 
 		 491 aa  48.9  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  29.29 
 
 		 153 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  31.2 
 
 		 561 aa  47  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.65 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 176 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  39.73 
 
 		 170 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  19.46 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  27.93 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  19.86 
 
 		 472 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  18.61 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  31.18 
 
 		 161 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  19.24 
 
 		 472 aa  45.4  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  25 
 
 		 472 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  34.88 
 
 		 171 aa  43.9  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  31.21 
 
 		 483 aa  43.9  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  30.43 
 
 		 161 aa  43.5  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  24.37 
 
 		 521 aa  43.5  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 		 186 aa  43.5  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>