46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1083 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  100 
 
 
515 aa  1033    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  22.67 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23.11 
 
 
632 aa  70.9  0.00000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  24.34 
 
 
491 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  24.5 
 
 
549 aa  63.5  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25.09 
 
 
575 aa  62  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  21.3 
 
 
476 aa  61.6  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  22.9 
 
 
486 aa  60.5  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  18.18 
 
 
472 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  20.86 
 
 
493 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  17.63 
 
 
472 aa  55.1  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  21.74 
 
 
575 aa  54.7  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  23.08 
 
 
619 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  24.72 
 
 
530 aa  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  24.24 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.79 
 
 
472 aa  51.2  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  25.28 
 
 
551 aa  50.8  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.45 
 
 
472 aa  50.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  22.75 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  22.75 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  19.43 
 
 
486 aa  48.5  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  27.6 
 
 
519 aa  48.5  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  21.45 
 
 
609 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  22.62 
 
 
504 aa  47  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  24.24 
 
 
488 aa  47  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  22.26 
 
 
539 aa  47  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  30.86 
 
 
700 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  21.22 
 
 
480 aa  46.6  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  18.6 
 
 
470 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 
167 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20.65 
 
 
472 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  21.37 
 
 
453 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.76 
 
 
471 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  17.61 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  20.82 
 
 
504 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  29.66 
 
 
486 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  29.66 
 
 
474 aa  45.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  19.5 
 
 
486 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  20.42 
 
 
472 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  28.57 
 
 
554 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.55 
 
 
472 aa  44.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  27.03 
 
 
177 aa  44.3  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  29.17 
 
 
159 aa  44.3  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  17.56 
 
 
480 aa  44.3  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  23.31 
 
 
634 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  23.08 
 
 
487 aa  43.5  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>