153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0548 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  100 
 
 		 491 aa  952    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  53.68 
 
 		 530 aa  422  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  49.89 
 
 		 575 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  47.68 
 
 		 555 aa  372  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  46.04 
 
 		 555 aa  361  2e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  43.32 
 
 		 521 aa  341  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  42.55 
 
 		 551 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  36.83 
 
 		 443 aa  238  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  34.58 
 
 		 561 aa  235  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  35.66 
 
 		 558 aa  233  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  36.32 
 
 		 469 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  36.52 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  36.54 
 
 		 489 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  36.77 
 
 		 483 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  37.31 
 
 		 766 aa  172  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  32.26 
 
 		 449 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  32.27 
 
 		 539 aa  152  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  28.74 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  31.4 
 
 		 467 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.09 
 
 		 549 aa  111  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  31.08 
 
 		 587 aa  98.2  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  25.75 
 
 		 632 aa  94.7  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.82 
 
 		 467 aa  86.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  25.78 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  23.4 
 
 		 479 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  25.43 
 
 		 486 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  28.08 
 
 		 554 aa  80.9  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  27.22 
 
 		 494 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  23.66 
 
 		 480 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  25.29 
 
 		 486 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  23.68 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  24.18 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  25.98 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  26.03 
 
 		 474 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.67 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  23.86 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  24.92 
 
 		 470 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  25.08 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  23.74 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  23.74 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  26.68 
 
 		 504 aa  70.5  0.00000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  22.89 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  22.66 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  23.53 
 
 		 472 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  26.32 
 
 		 609 aa  68.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  21.76 
 
 		 504 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  21.78 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  22.2 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  26.3 
 
 		 515 aa  66.6  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  24.64 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  22.71 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  31.36 
 
 		 519 aa  64.7  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  34.48 
 
 		 498 aa  63.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  23.29 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  22.89 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  31.93 
 
 		 152 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  29.49 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  40.21 
 
 		 167 aa  61.6  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  43.75 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  27.64 
 
 		 619 aa  60.5  0.00000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28.95 
 
 		 547 aa  60.1  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  22.41 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  42.5 
 
 		 182 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  21.28 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  20.83 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  20.12 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  23.78 
 
 		 514 aa  57.4  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  25.46 
 
 		 634 aa  56.2  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  24.46 
 
 		 646 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  17.3 
 
 		 495 aa  56.6  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  17.46 
 
 		 501 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.56 
 
 		 180 aa  55.8  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  38.82 
 
 		 174 aa  55.1  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  22.71 
 
 		 506 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  39.77 
 
 		 183 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  27.18 
 
 		 169 aa  54.3  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  29.73 
 
 		 491 aa  53.9  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  40.91 
 
 		 171 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  34.87 
 
 		 658 aa  52.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  37.23 
 
 		 165 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  36.47 
 
 		 165 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  37.08 
 
 		 174 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  39.02 
 
 		 512 aa  52.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  29.59 
 
 		 203 aa  52.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  37.36 
 
 		 161 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  19.54 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  36.17 
 
 		 170 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  35.23 
 
 		 167 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  35 
 
 		 508 aa  51.2  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  28.8 
 
 		 533 aa  50.8  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  33 
 
 		 165 aa  50.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  22.01 
 
 		 492 aa  50.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  26.99 
 
 		 377 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  25.93 
 
 		 550 aa  50.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  16.83 
 
 		 506 aa  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  24.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  32 
 
 		 195 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  24.67 
 
 		 158 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  37.66 
 
 		 171 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  29.52 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>