170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1204 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 632 aa  1248    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  47.06 
 
 		 486 aa  420  1e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  39.85 
 
 		 547 aa  316  9e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  38.1 
 
 		 549 aa  296  8e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  38.42 
 
 		 579 aa  281  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  39.64 
 
 		 646 aa  236  7e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  29.53 
 
 		 467 aa  157  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 494 aa  146  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  27.87 
 
 		 493 aa  118  3e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  26.43 
 
 		 501 aa  116  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  28.99 
 
 		 480 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  24.83 
 
 		 575 aa  104  4e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  25.2 
 
 		 619 aa  101  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  24.85 
 
 		 561 aa  100  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  26.15 
 
 		 527 aa  95.1  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  26.61 
 
 		 476 aa  95.5  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  26.11 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  27.7 
 
 		 489 aa  95.5  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  22.15 
 
 		 504 aa  94.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  25.36 
 
 		 609 aa  89.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  25.88 
 
 		 449 aa  90.1  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  23.8 
 
 		 555 aa  89.7  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.24 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  21.37 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25.05 
 
 		 575 aa  84.3  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.88 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  21.23 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  22.78 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.47 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  22.84 
 
 		 513 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  21.9 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  23.21 
 
 		 514 aa  82  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  25.32 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  23.4 
 
 		 530 aa  81.6  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  19.7 
 
 		 470 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  20.13 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  19.8 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.58 
 
 		 471 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.15 
 
 		 474 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20.77 
 
 		 472 aa  78.2  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.58 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  22.86 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  27.76 
 
 		 539 aa  76.6  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  22.54 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  22.54 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  31.29 
 
 		 512 aa  75.5  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.76 
 
 		 480 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  25.29 
 
 		 506 aa  74.3  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0845  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  45.36 
 
 		 698 aa  74.3  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.676363 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  20.77 
 
 		 471 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  26.34 
 
 		 501 aa  70.5  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  20 
 
 		 542 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  23.29 
 
 		 515 aa  70.5  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  33.93 
 
 		 161 aa  70.1  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.77 
 
 		 476 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  20.05 
 
 		 504 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  28.03 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  25.25 
 
 		 766 aa  67.4  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  19.71 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  20.93 
 
 		 551 aa  66.6  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  21.32 
 
 		 495 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  24.92 
 
 		 634 aa  66.2  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  21.77 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  27.79 
 
 		 532 aa  65.1  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  27.21 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  36.36 
 
 		 153 aa  65.1  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  27 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  25.15 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  27.13 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  19.51 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  27.15 
 
 		 522 aa  62  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  20.63 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  17.52 
 
 		 527 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  17.52 
 
 		 527 aa  60.5  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  38.14 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  32.74 
 
 		 176 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  35.96 
 
 		 508 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  33.72 
 
 		 700 aa  60.1  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  38.55 
 
 		 153 aa  58.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  30.87 
 
 		 167 aa  58.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  23.93 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  31.48 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  40 
 
 		 161 aa  58.2  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  19.84 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  18.51 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  25.08 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  28.93 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  25.54 
 
 		 488 aa  57.4  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  28.1 
 
 		 158 aa  57  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  28.44 
 
 		 203 aa  56.6  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  28.1 
 
 		 158 aa  57  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  30.59 
 
 		 555 aa  57  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.62 
 
 		 643 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  28.1 
 
 		 158 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  38.16 
 
 		 162 aa  55.5  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  31.43 
 
 		 153 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  28.1 
 
 		 158 aa  55.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  28.97 
 
 		 554 aa  55.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  29.76 
 
 		 177 aa  55.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  31.87 
 
 		 165 aa  54.7  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>