49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0832 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  100 
 
 
542 aa  1055    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  23.81 
 
 
486 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  22.91 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  24.37 
 
 
474 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  23.81 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  24.15 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  23.38 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  22.48 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  22.04 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.98 
 
 
453 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  22.48 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  22.48 
 
 
472 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  22.92 
 
 
486 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  22.98 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  21.09 
 
 
483 aa  68.2  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.9 
 
 
472 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.1 
 
 
471 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  22.07 
 
 
479 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  23.38 
 
 
480 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.07 
 
 
470 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  20.09 
 
 
632 aa  67  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  21.68 
 
 
472 aa  67  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.3 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  22.76 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  22.33 
 
 
506 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  20.32 
 
 
493 aa  60.8  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  19.56 
 
 
480 aa  58.2  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  27.45 
 
 
551 aa  57.4  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  21.14 
 
 
579 aa  57.4  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.44 
 
 
476 aa  55.8  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  25.71 
 
 
377 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  18.1 
 
 
547 aa  55.5  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  19.96 
 
 
486 aa  54.3  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  16.77 
 
 
575 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  20.17 
 
 
527 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  20.17 
 
 
527 aa  50.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  24.17 
 
 
521 aa  50.4  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  21.47 
 
 
501 aa  50.1  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  19.83 
 
 
513 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25 
 
 
494 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  20.46 
 
 
646 aa  49.3  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  18.88 
 
 
542 aa  47  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  27.52 
 
 
232 aa  47  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  26.4 
 
 
170 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  22.02 
 
 
554 aa  46.2  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  18.06 
 
 
544 aa  45.4  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  29.63 
 
 
177 aa  44.3  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  22.45 
 
 
643 aa  43.9  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  16.42 
 
 
506 aa  43.5  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>