136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2526 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
480 aa  970    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  46.83 
 
 
493 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  27.98 
 
 
479 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  28.34 
 
 
486 aa  177  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  28.46 
 
 
480 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  29.27 
 
 
474 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  29.65 
 
 
486 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  29.49 
 
 
474 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  27.8 
 
 
470 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  25.73 
 
 
472 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  25.73 
 
 
472 aa  166  8e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  27.35 
 
 
471 aa  163  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  25.94 
 
 
472 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  26 
 
 
471 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  25.26 
 
 
472 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  26.33 
 
 
476 aa  159  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  26.69 
 
 
472 aa  159  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  26.4 
 
 
453 aa  156  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  25.52 
 
 
472 aa  156  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  25.94 
 
 
472 aa  154  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  26.67 
 
 
472 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  31.56 
 
 
486 aa  147  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  28.23 
 
 
377 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.89 
 
 
549 aa  130  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  22.63 
 
 
501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.93 
 
 
512 aa  125  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  26.34 
 
 
501 aa  124  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  22.32 
 
 
527 aa  123  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  22.32 
 
 
527 aa  123  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  29.35 
 
 
632 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  28.8 
 
 
467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  25.22 
 
 
506 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  31.28 
 
 
498 aa  107  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  25.19 
 
 
547 aa  107  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  21.17 
 
 
495 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  25.16 
 
 
516 aa  99.8  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  25.3 
 
 
483 aa  98.6  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25.32 
 
 
575 aa  94.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  25.93 
 
 
554 aa  94  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  22.51 
 
 
504 aa  93.6  7e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  25.66 
 
 
476 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  21.85 
 
 
506 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  25.1 
 
 
449 aa  83.6  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  27.24 
 
 
646 aa  81.3  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  26.1 
 
 
561 aa  80.5  0.00000000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  23.97 
 
 
575 aa  80.5  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25.23 
 
 
494 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  25.07 
 
 
609 aa  77.8  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  24.04 
 
 
491 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  24.65 
 
 
619 aa  73.6  0.000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  23.76 
 
 
489 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  39.62 
 
 
579 aa  70.5  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  26.8 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  20.38 
 
 
541 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  19.73 
 
 
504 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  23.76 
 
 
488 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  22.54 
 
 
554 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  24.8 
 
 
443 aa  67  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  19.96 
 
 
542 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30.15 
 
 
673 aa  63.9  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  25.24 
 
 
469 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  23.91 
 
 
480 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  17.71 
 
 
472 aa  63.5  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  23.85 
 
 
486 aa  63.5  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  22.1 
 
 
513 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  21.59 
 
 
542 aa  63.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  27.22 
 
 
700 aa  62.4  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  17.05 
 
 
472 aa  61.2  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  24.71 
 
 
634 aa  60.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  21.41 
 
 
530 aa  60.1  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  23.55 
 
 
474 aa  60.1  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  21.96 
 
 
491 aa  60.1  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  23.43 
 
 
486 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  21.06 
 
 
527 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 
551 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  24 
 
 
540 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  21.4 
 
 
487 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  23.57 
 
 
483 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  26.19 
 
 
504 aa  55.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  22.29 
 
 
521 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  24.76 
 
 
519 aa  55.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  26.55 
 
 
643 aa  53.9  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  31.48 
 
 
558 aa  53.5  0.000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  27.73 
 
 
169 aa  52.4  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  25.8 
 
 
501 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  28.18 
 
 
555 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  24.57 
 
 
766 aa  50.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  30.07 
 
 
507 aa  50.4  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  30.17 
 
 
114 aa  50.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  31.11 
 
 
539 aa  50.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  21.19 
 
 
515 aa  49.7  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  28.46 
 
 
179 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  28.46 
 
 
179 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  29.21 
 
 
158 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  29.21 
 
 
158 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  29.21 
 
 
158 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  24.75 
 
 
190 aa  48.5  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  27.69 
 
 
179 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  19.87 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  29.21 
 
 
158 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>