90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3582 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 507 aa  984    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  42.44 
 
 		 511 aa  310  5e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  36.17 
 
 		 609 aa  263  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  35.79 
 
 		 527 aa  227  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  37.37 
 
 		 501 aa  224  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  37.34 
 
 		 516 aa  218  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  34.52 
 
 		 491 aa  203  5e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  34.59 
 
 		 487 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  37.72 
 
 		 486 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  37.72 
 
 		 486 aa  189  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  36.11 
 
 		 480 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  33.27 
 
 		 504 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  36.14 
 
 		 483 aa  182  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  37.55 
 
 		 474 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  30.02 
 
 		 611 aa  177  4e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  30.25 
 
 		 554 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  31.23 
 
 		 554 aa  156  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  33.63 
 
 		 519 aa  156  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  30.02 
 
 		 540 aa  152  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  34.55 
 
 		 550 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  34.41 
 
 		 488 aa  149  9e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 		 643 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  31.19 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  29.59 
 
 		 634 aa  143  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  30.81 
 
 		 508 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  33.24 
 
 		 658 aa  120  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  23.33 
 
 		 479 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.86 
 
 		 470 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.45 
 
 		 471 aa  100  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  22.66 
 
 		 480 aa  100  7e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  22.43 
 
 		 486 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.06 
 
 		 486 aa  94  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.94 
 
 		 474 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.94 
 
 		 476 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  21.64 
 
 		 474 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  22.39 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.94 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  19.77 
 
 		 471 aa  76.6  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  20.43 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  19.78 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  19.78 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.24 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20 
 
 		 472 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  19.78 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  19.77 
 
 		 493 aa  66.6  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  27.36 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  26.64 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.32 
 
 		 467 aa  62  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  19.61 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  30.25 
 
 		 575 aa  60.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  18.62 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  29.32 
 
 		 512 aa  60.1  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  25.82 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  24.4 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  28.51 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  26.69 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  28.72 
 
 		 673 aa  53.9  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  23.3 
 
 		 492 aa  53.5  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  23.79 
 
 		 575 aa  53.5  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.53 
 
 		 486 aa  53.1  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  28.67 
 
 		 469 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  27.32 
 
 		 195 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  26.58 
 
 		 476 aa  52.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  37.29 
 
 		 646 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  21.28 
 
 		 504 aa  50.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  31.16 
 
 		 165 aa  50.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  37.65 
 
 		 555 aa  50.1  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.65 
 
 		 530 aa  49.7  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 		 555 aa  49.3  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  25.9 
 
 		 506 aa  47.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  40.74 
 
 		 172 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  30.84 
 
 		 185 aa  47.4  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  29.21 
 
 		 483 aa  47.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  28.68 
 
 		 195 aa  47  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  29.73 
 
 		 169 aa  47  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  26.83 
 
 		 176 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  35.16 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  28.38 
 
 		 177 aa  46.2  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  33.33 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  32.74 
 
 		 159 aa  46.2  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  23.2 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  41.46 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 186 aa  45.8  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  23.88 
 
 		 632 aa  45.8  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  19.59 
 
 		 514 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  40.98 
 
 		 167 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.4 
 
 		 170 aa  44.3  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  39.13 
 
 		 174 aa  44.3  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  32.2 
 
 		 166 aa  43.9  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  33.71 
 
 		 161 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>