58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2913 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  100 
 
 		 492 aa  990    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  41.78 
 
 		 541 aa  397  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  41.78 
 
 		 514 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  43.02 
 
 		 522 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  43.44 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  41.86 
 
 		 513 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  28.79 
 
 		 542 aa  176  6e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  24.76 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  25.1 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  23.57 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  23.33 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  42.86 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  22.77 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  21.92 
 
 		 486 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  24.71 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  21.74 
 
 		 575 aa  58.5  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  22.4 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  25.34 
 
 		 549 aa  57.8  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  22.05 
 
 		 634 aa  53.9  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  23.91 
 
 		 476 aa  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  22.4 
 
 		 646 aa  52  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  28.85 
 
 		 180 aa  51.6  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  20.18 
 
 		 632 aa  50.4  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 508 aa  49.3  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  30 
 
 		 611 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  24.53 
 
 		 587 aa  49.3  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.8 
 
 		 467 aa  49.3  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.08 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  24.26 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  23.15 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.97 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  25.4 
 
 		 449 aa  47.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  23.28 
 
 		 547 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  20.14 
 
 		 493 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  28.57 
 
 		 169 aa  47  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  26.32 
 
 		 165 aa  47.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  23.29 
 
 		 480 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  22.71 
 
 		 507 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  21.27 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  26.13 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  24.37 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20.5 
 
 		 476 aa  45.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 		 180 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 		 180 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 		 180 aa  45.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  24.27 
 
 		 487 aa  45.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  22.73 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  24.76 
 
 		 521 aa  44.7  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  32.05 
 
 		 166 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  29.9 
 
 		 176 aa  44.7  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  23.3 
 
 		 504 aa  44.7  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  28.85 
 
 		 555 aa  44.3  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  30.59 
 
 		 579 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  29.07 
 
 		 555 aa  44.3  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  36.71 
 
 		 174 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  29.33 
 
 		 176 aa  43.9  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  23.08 
 
 		 527 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  25.53 
 
 		 554 aa  43.5  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>