90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4358 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 443 aa  859    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  61.1 
 
 		 469 aa  479  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  35.46 
 
 		 521 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  34.75 
 
 		 551 aa  226  6e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  36.48 
 
 		 491 aa  224  2e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  37.01 
 
 		 530 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  39.31 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  34.14 
 
 		 575 aa  213  4.9999999999999996e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  34.57 
 
 		 555 aa  194  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  33.76 
 
 		 449 aa  192  7e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  35.7 
 
 		 489 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  34.07 
 
 		 476 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  32.53 
 
 		 555 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  30.18 
 
 		 561 aa  176  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  36.51 
 
 		 766 aa  149  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  35.96 
 
 		 539 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  30.77 
 
 		 558 aa  99  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.33 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.09 
 
 		 512 aa  82.8  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  30.14 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  28.57 
 
 		 504 aa  77  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  24.27 
 
 		 549 aa  76.3  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  32.1 
 
 		 587 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  24.63 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  29.1 
 
 		 467 aa  67  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  25.12 
 
 		 540 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  20.32 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  21.54 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  21.49 
 
 		 632 aa  63.2  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  21.82 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  20.76 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  37.88 
 
 		 609 aa  58.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.53 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  21.21 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.67 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  21.32 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.22 
 
 		 494 aa  57  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  27.94 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.72 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  20.62 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  20.62 
 
 		 472 aa  56.6  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  22.4 
 
 		 513 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  32.35 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  22.98 
 
 		 522 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 516 aa  55.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  39.44 
 
 		 498 aa  55.1  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  34.31 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  21.35 
 
 		 542 aa  55.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  32.85 
 
 		 480 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  20.83 
 
 		 479 aa  54.3  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  20.7 
 
 		 470 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  29.66 
 
 		 646 aa  53.9  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  20.96 
 
 		 472 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  28.48 
 
 		 547 aa  52.8  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  19.94 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.97 
 
 		 486 aa  51.6  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  27.42 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  34.06 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 		 474 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 		 486 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  30.39 
 
 		 532 aa  51.6  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  38.21 
 
 		 550 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  28.42 
 
 		 579 aa  50.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  25 
 
 		 673 aa  50.1  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  32.58 
 
 		 554 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  34 
 
 		 491 aa  48.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.58 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  29.06 
 
 		 575 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  26.19 
 
 		 634 aa  47  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  29.87 
 
 		 471 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  28.08 
 
 		 511 aa  46.6  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.07 
 
 		 474 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  28.16 
 
 		 167 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  28.89 
 
 		 700 aa  46.2  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  35.16 
 
 		 507 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  29.8 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  23.42 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  20.51 
 
 		 474 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  26.67 
 
 		 177 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  18.45 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 519 aa  44.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  34.69 
 
 		 190 aa  44.3  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 		 176 aa  44.3  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  36.36 
 
 		 165 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  20.69 
 
 		 541 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  30.71 
 
 		 658 aa  43.5  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  27.96 
 
 		 619 aa  43.1  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 170 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  43.14 
 
 		 643 aa  43.1  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>