72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3800 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 501 aa  947    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  42.72 
 
 		 609 aa  330  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  42.86 
 
 		 491 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  39.02 
 
 		 527 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  40.52 
 
 		 516 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  38.24 
 
 		 507 aa  230  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  38.43 
 
 		 487 aa  224  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  38.34 
 
 		 486 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  35.19 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  39.19 
 
 		 483 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  37.24 
 
 		 486 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  37.3 
 
 		 480 aa  210  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  37.24 
 
 		 474 aa  210  4e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  39.82 
 
 		 550 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  35.46 
 
 		 554 aa  185  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  34.7 
 
 		 519 aa  183  8.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  34.73 
 
 		 540 aa  182  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  36.54 
 
 		 504 aa  177  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  35.59 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  32.28 
 
 		 634 aa  158  3e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  30.68 
 
 		 611 aa  148  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  41.32 
 
 		 658 aa  139  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  32.27 
 
 		 554 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  31.35 
 
 		 508 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.87 
 
 		 632 aa  93.6  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  23.17 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  22.53 
 
 		 486 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.83 
 
 		 549 aa  77.8  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.3 
 
 		 486 aa  77.8  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  29.18 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  25.17 
 
 		 486 aa  74.7  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  23.76 
 
 		 474 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.51 
 
 		 512 aa  73.2  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.22 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.31 
 
 		 471 aa  70.1  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.62 
 
 		 470 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  23.12 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  26.35 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  22.08 
 
 		 479 aa  65.5  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  40.23 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.18 
 
 		 547 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  28.87 
 
 		 646 aa  63.5  0.000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  25.45 
 
 		 575 aa  63.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  27.1 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.8 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  22.85 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  25.22 
 
 		 480 aa  54.3  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  35.26 
 
 		 469 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  23.38 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  39.36 
 
 		 532 aa  50.4  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  26.01 
 
 		 476 aa  50.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  34.69 
 
 		 643 aa  49.3  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  23.28 
 
 		 575 aa  49.3  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  31.53 
 
 		 152 aa  49.3  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  18.57 
 
 		 501 aa  47.4  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.89 
 
 		 467 aa  47.4  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  28.71 
 
 		 161 aa  47.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  31.54 
 
 		 195 aa  47.4  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  34.52 
 
 		 579 aa  47.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  27.03 
 
 		 443 aa  47.4  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  22.15 
 
 		 521 aa  47  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  28.83 
 
 		 180 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  24.58 
 
 		 489 aa  46.2  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  17.61 
 
 		 541 aa  45.8  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  33.72 
 
 		 172 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  30.91 
 
 		 180 aa  44.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  32.79 
 
 		 163 aa  44.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  23.95 
 
 		 491 aa  44.3  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  27.93 
 
 		 180 aa  44.3  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  30.93 
 
 		 195 aa  43.9  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  29.91 
 
 		 164 aa  44.3  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 180 aa  43.5  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>