125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1949 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  337  5e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  57.65 
 
 
193 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  52.98 
 
 
186 aa  168  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  58.04 
 
 
167 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  44.05 
 
 
165 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  42.35 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  40.83 
 
 
161 aa  112  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  41.38 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  40.35 
 
 
177 aa  103  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  38.15 
 
 
166 aa  101  5e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  38.46 
 
 
164 aa  101  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  39.88 
 
 
196 aa  100  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  37.79 
 
 
165 aa  98.2  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  47.79 
 
 
181 aa  95.9  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  38.75 
 
 
174 aa  94.4  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  38.37 
 
 
164 aa  92.8  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  38.01 
 
 
170 aa  93.2  2e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  38.24 
 
 
168 aa  87.8  7e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  36.09 
 
 
174 aa  87.8  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 
165 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  39.04 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  46.88 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  43.3 
 
 
177 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  45.26 
 
 
160 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  34.73 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  35.9 
 
 
159 aa  65.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  33.12 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  40.24 
 
 
171 aa  63.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  38.46 
 
 
183 aa  62.4  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  38.32 
 
 
170 aa  58.5  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  42.25 
 
 
182 aa  58.2  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  26.71 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  26.71 
 
 
158 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  28.3 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  26.25 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  26.25 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  43.84 
 
 
183 aa  57  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  28.93 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  26.25 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  29.88 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  37.84 
 
 
171 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  27.67 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  26.25 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  26.25 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  27.67 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  36.08 
 
 
646 aa  56.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  27.67 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  27.04 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  27.67 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  26.25 
 
 
158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  26.71 
 
 
158 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  27.04 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  26.88 
 
 
158 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  27.04 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  40.85 
 
 
182 aa  55.1  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  26.71 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  30.18 
 
 
163 aa  55.1  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  39.73 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  38.64 
 
 
555 aa  54.3  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  29.79 
 
 
163 aa  53.9  0.0000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  33.93 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  31.52 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  38.36 
 
 
167 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  33.02 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  38.55 
 
 
658 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  26.09 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  24.05 
 
 
162 aa  52  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  34.02 
 
 
162 aa  51.2  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.77 
 
 
547 aa  50.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  32.48 
 
 
150 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  31.15 
 
 
195 aa  50.1  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  38.2 
 
 
575 aa  49.7  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  34.44 
 
 
530 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  33.71 
 
 
161 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  31.13 
 
 
579 aa  49.3  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  35.21 
 
 
148 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  35.62 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  34.04 
 
 
153 aa  48.5  0.00005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  42.37 
 
 
550 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  26.71 
 
 
203 aa  48.1  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  22.45 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  40.74 
 
 
507 aa  47.8  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  21.36 
 
 
159 aa  47.4  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  34.15 
 
 
486 aa  47  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  32.93 
 
 
155 aa  47  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  37.8 
 
 
498 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  29.55 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  29.55 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
153 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  36.36 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  24.18 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 
191 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  31.03 
 
 
554 aa  45.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  27.82 
 
 
159 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  36.14 
 
 
555 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  28.47 
 
 
549 aa  45.1  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  33.72 
 
 
501 aa  45.1  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>