98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0224 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 488 aa  915    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  40.23 
 
 		 554 aa  233  6e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  38.6 
 
 		 643 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  39.53 
 
 		 508 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  40.04 
 
 		 532 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  39.87 
 
 		 516 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  32.66 
 
 		 609 aa  193  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  34.47 
 
 		 527 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  37.09 
 
 		 519 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  36.42 
 
 		 491 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  34.98 
 
 		 483 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 554 aa  162  9e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  36.02 
 
 		 501 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  34.84 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  35.66 
 
 		 487 aa  152  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  33 
 
 		 507 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  33.11 
 
 		 634 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  32.08 
 
 		 511 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  33.26 
 
 		 486 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  33.12 
 
 		 474 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  33.47 
 
 		 486 aa  136  8e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  32.58 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  33.49 
 
 		 550 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  29.75 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  26.47 
 
 		 611 aa  106  9e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  22.38 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  36.59 
 
 		 658 aa  93.6  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.98 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  29.78 
 
 		 561 aa  91.7  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  20.6 
 
 		 474 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.7 
 
 		 480 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.94 
 
 		 480 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  20.28 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  20.81 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  19.68 
 
 		 474 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  23.28 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  20.94 
 
 		 486 aa  84  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.43 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  27.88 
 
 		 547 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.52 
 
 		 549 aa  81.6  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  21.14 
 
 		 471 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  27.59 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  26.91 
 
 		 575 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  25.49 
 
 		 632 aa  72.4  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  19.75 
 
 		 453 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  19.26 
 
 		 471 aa  70.5  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  30.12 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  21.03 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  20.29 
 
 		 472 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  27.94 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  20.43 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  20.43 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.41 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  20.06 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  29.1 
 
 		 489 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  20 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  28.41 
 
 		 530 aa  59.7  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  19.95 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  24.22 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.78 
 
 		 512 aa  59.7  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  25.83 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  20.47 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  39.29 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  39.33 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.56 
 
 		 467 aa  57  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  26.39 
 
 		 515 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  27 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  26.02 
 
 		 494 aa  53.9  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  21.03 
 
 		 504 aa  53.5  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  33.33 
 
 		 190 aa  52.8  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  24.44 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 		 170 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  26.14 
 
 		 491 aa  51.2  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.53 
 
 		 483 aa  50.4  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  30.1 
 
 		 177 aa  50.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.83 
 
 		 579 aa  50.1  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  35.51 
 
 		 182 aa  49.7  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  32.48 
 
 		 171 aa  48.5  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  38.1 
 
 		 165 aa  48.9  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  31.96 
 
 		 183 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  31.11 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  25.08 
 
 		 551 aa  48.5  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  28.19 
 
 		 469 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  26.44 
 
 		 539 aa  47.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 148 aa  47.4  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  27.27 
 
 		 521 aa  47.4  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  24.81 
 
 		 522 aa  47  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  30.61 
 
 		 575 aa  47  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  26.28 
 
 		 158 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  28.26 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  34.94 
 
 		 165 aa  46.6  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  37.8 
 
 		 171 aa  45.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  34.52 
 
 		 150 aa  45.8  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  35.58 
 
 		 184 aa  44.7  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 161 aa  44.7  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  18.71 
 
 		 513 aa  43.9  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  18.54 
 
 		 541 aa  43.9  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  35.71 
 
 		 174 aa  43.5  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>