129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3030 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
182 aa  347  4e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  87.91 
 
 
182 aa  261  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  53.8 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  48.21 
 
 
165 aa  128  5.0000000000000004e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  50.31 
 
 
167 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  48.52 
 
 
171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  47.06 
 
 
174 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  59.09 
 
 
183 aa  120  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  67.02 
 
 
171 aa  120  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  48.73 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  64.13 
 
 
174 aa  117  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  58.65 
 
 
161 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  42.94 
 
 
170 aa  114  7.999999999999999e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  54.26 
 
 
150 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  51.69 
 
 
148 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  45.26 
 
 
188 aa  85.5  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  44.44 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  83.6  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  36.5 
 
 
159 aa  72  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  35.16 
 
 
190 aa  68.9  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  29.85 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  28.87 
 
 
203 aa  64.7  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  36.14 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  36.14 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  36.14 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  36.14 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  36.14 
 
 
158 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  36.14 
 
 
158 aa  62.8  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  36.14 
 
 
158 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  37.35 
 
 
158 aa  62  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  38.78 
 
 
153 aa  62  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  29.2 
 
 
158 aa  61.6  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  41.57 
 
 
161 aa  61.6  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  29.91 
 
 
158 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  29.91 
 
 
158 aa  61.2  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  34.94 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 
158 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  36.71 
 
 
170 aa  59.3  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  37.35 
 
 
153 aa  59.3  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  33.05 
 
 
153 aa  58.9  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  28.97 
 
 
158 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  42.5 
 
 
491 aa  58.5  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 
216 aa  58.5  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  44.16 
 
 
155 aa  58.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  28.97 
 
 
158 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  31.33 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  31.33 
 
 
158 aa  57.8  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
160 aa  57.8  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  31.33 
 
 
158 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  35.71 
 
 
228 aa  57.8  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  36.05 
 
 
153 aa  57.8  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  30.12 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  30.12 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  45.07 
 
 
168 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  40.45 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  34.34 
 
 
242 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  32.1 
 
 
152 aa  56.2  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  40.85 
 
 
172 aa  55.5  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  29.49 
 
 
165 aa  55.1  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  30.82 
 
 
163 aa  54.7  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  35.85 
 
 
766 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  27.22 
 
 
207 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  49.28 
 
 
159 aa  53.9  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  37.04 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  34.91 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  38.96 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  37.35 
 
 
159 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  27.2 
 
 
242 aa  52.4  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  40.28 
 
 
555 aa  52.4  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  35.21 
 
 
558 aa  51.6  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  42.86 
 
 
174 aa  50.4  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  38.16 
 
 
632 aa  50.4  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  33.7 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  42.86 
 
 
165 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  43.84 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  35.43 
 
 
166 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  40.79 
 
 
530 aa  49.7  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  37.84 
 
 
646 aa  49.3  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  36.62 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  36.62 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  31.01 
 
 
673 aa  49.3  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  36.73 
 
 
186 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  39.71 
 
 
167 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  42.19 
 
 
161 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  22.31 
 
 
169 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  40.22 
 
 
160 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  37.33 
 
 
196 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  43.28 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  29.41 
 
 
155 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
195 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  41.03 
 
 
160 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  32.06 
 
 
476 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  36.84 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  30.53 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  31.71 
 
 
700 aa  46.6  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  35.77 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  35.77 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  35.77 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  50 
 
 
550 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  30.34 
 
 
507 aa  45.8  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>