94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0223 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 469 aa  908    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  59.13 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  35.25 
 
 		 521 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  33.12 
 
 		 551 aa  223  4e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  34.78 
 
 		 575 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  35.37 
 
 		 491 aa  207  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  39.68 
 
 		 483 aa  204  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.79 
 
 		 530 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  33.6 
 
 		 555 aa  186  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  35.73 
 
 		 489 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  31.67 
 
 		 449 aa  172  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  33.83 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  29.76 
 
 		 561 aa  156  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  35.01 
 
 		 766 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  34.77 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  33.21 
 
 		 555 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  33.93 
 
 		 558 aa  91.3  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.46 
 
 		 486 aa  90.5  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  31.65 
 
 		 554 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.58 
 
 		 467 aa  79.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2981  membrane-flanked domain protein  29.74 
 
 		 467 aa  71.2  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  22.88 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  32.32 
 
 		 587 aa  69.3  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  28.3 
 
 		 504 aa  65.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  24.49 
 
 		 634 aa  65.1  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.14 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  28.24 
 
 		 540 aa  62.8  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.88 
 
 		 480 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.83 
 
 		 632 aa  60.8  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.52 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  20.86 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  24.84 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  22.73 
 
 		 472 aa  59.3  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  23.53 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  35.88 
 
 		 609 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  20.38 
 
 		 501 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  21.29 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  19.06 
 
 		 483 aa  57  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  21.1 
 
 		 476 aa  56.6  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  22.75 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  28.32 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  28.28 
 
 		 486 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  22.75 
 
 		 472 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  23.2 
 
 		 471 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  22.69 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  22.93 
 
 		 470 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.79 
 
 		 479 aa  55.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.27 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  35.26 
 
 		 501 aa  53.9  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 		 658 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  28.12 
 
 		 486 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  24.07 
 
 		 549 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  28.28 
 
 		 474 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  22.73 
 
 		 486 aa  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  22.41 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  26.55 
 
 		 480 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  20.59 
 
 		 504 aa  51.6  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  32.29 
 
 		 700 aa  51.2  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  28.29 
 
 		 579 aa  50.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  34.65 
 
 		 507 aa  50.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  28.32 
 
 		 487 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  20.76 
 
 		 471 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.83 
 
 		 474 aa  50.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 		 514 aa  50.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  22.08 
 
 		 474 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  31.9 
 
 		 575 aa  49.7  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  38.1 
 
 		 516 aa  49.3  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  31.4 
 
 		 547 aa  48.9  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  35.71 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  40.91 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  20.42 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  30.36 
 
 		 619 aa  49.3  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  36.08 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  24.03 
 
 		 646 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  27.18 
 
 		 176 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  34.34 
 
 		 611 aa  47  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  27.95 
 
 		 519 aa  47  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  32.5 
 
 		 522 aa  47  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  32.8 
 
 		 550 aa  47  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  24.84 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  30.77 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  38.33 
 
 		 190 aa  45.8  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  26.5 
 
 		 170 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  22.12 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  33.04 
 
 		 483 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  34.18 
 
 		 195 aa  45.1  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  28.09 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  35.87 
 
 		 186 aa  44.3  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  27.72 
 
 		 513 aa  44.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  25.68 
 
 		 542 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  24.73 
 
 		 169 aa  43.9  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30.11 
 
 		 673 aa  43.9  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  32.43 
 
 		 161 aa  43.5  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  36.45 
 
 		 184 aa  43.5  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>