81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2887 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  100 
 
 		 766 aa  1483    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  52.73 
 
 		 539 aa  361  3e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  45.85 
 
 		 483 aa  306  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  37.31 
 
 		 491 aa  192  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  33.08 
 
 		 521 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  36.08 
 
 		 443 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  32.92 
 
 		 575 aa  169  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  33.9 
 
 		 530 aa  167  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  34.51 
 
 		 555 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  36.3 
 
 		 551 aa  155  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  33.67 
 
 		 469 aa  152  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  34.97 
 
 		 476 aa  147  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  28.54 
 
 		 449 aa  119  3e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  29.9 
 
 		 561 aa  113  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  32.8 
 
 		 555 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  32.58 
 
 		 558 aa  94.7  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  28.49 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.39 
 
 		 632 aa  68.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.79 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  28.23 
 
 		 554 aa  64.7  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  28.7 
 
 		 504 aa  64.3  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  22.53 
 
 		 513 aa  62.4  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  22.13 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  27.9 
 
 		 2914 aa  61.2  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  28.49 
 
 		 516 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  29.17 
 
 		 547 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  35 
 
 		 587 aa  59.7  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  28.9 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  31.37 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  32.08 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  25.21 
 
 		 467 aa  58.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  27.52 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  23.46 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  23.77 
 
 		 472 aa  57  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  27.01 
 
 		 646 aa  57.4  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  24.44 
 
 		 540 aa  56.2  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  23.36 
 
 		 472 aa  55.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  23.28 
 
 		 470 aa  54.7  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  25.69 
 
 		 506 aa  54.3  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  23.36 
 
 		 472 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  23.36 
 
 		 472 aa  54.3  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  26.06 
 
 		 527 aa  53.9  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  29 
 
 		 634 aa  53.9  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  23.25 
 
 		 472 aa  53.9  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.21 
 
 		 579 aa  53.9  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  26.87 
 
 		 550 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 491 aa  53.1  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 541 aa  53.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  36.63 
 
 		 498 aa  53.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  28.67 
 
 		 575 aa  53.5  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  23.36 
 
 		 472 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  42.86 
 
 		 182 aa  52.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  26.81 
 
 		 487 aa  52.8  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  35.82 
 
 		 643 aa  51.2  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  31.03 
 
 		 554 aa  50.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  38.68 
 
 		 182 aa  50.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  33.09 
 
 		 169 aa  48.9  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  22.37 
 
 		 472 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 508 aa  48.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  19.59 
 
 		 493 aa  47.4  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  27.99 
 
 		 519 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  21.98 
 
 		 471 aa  47  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  24.82 
 
 		 492 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  43.66 
 
 		 159 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  21.98 
 
 		 453 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  25.95 
 
 		 176 aa  45.8  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  31.78 
 
 		 609 aa  45.8  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  25.86 
 
 		 177 aa  45.8  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  26 
 
 		 673 aa  46.2  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  36.59 
 
 		 196 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  32.95 
 
 		 486 aa  45.1  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  32.95 
 
 		 486 aa  45.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  30.67 
 
 		 512 aa  45.1  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  20.93 
 
 		 483 aa  45.1  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  32.95 
 
 		 474 aa  45.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  25.52 
 
 		 480 aa  44.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  39.73 
 
 		 183 aa  44.7  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  32.17 
 
 		 161 aa  44.7  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  37.5 
 
 		 171 aa  44.3  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2398  accumulation associated protein  29.91 
 
 		 2397 aa  44.3  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.53067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>