25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2015 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  100 
 
 		 161 aa  323  5e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4056  hypothetical protein  31.58 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3759  hypothetical protein  32.74 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  36.63 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  37.84 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  29.77 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  24.35 
 
 		 127 aa  44.3  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  27.59 
 
 		 181 aa  44.3  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  31.25 
 
 		 521 aa  43.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3697  membrane-flanked domain-containing protein  31.08 
 
 		 174 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505338  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  30.59 
 
 		 542 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  29.63 
 
 		 179 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  28.38 
 
 		 155 aa  42  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  31.37 
 
 		 491 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  28.3 
 
 		 203 aa  42  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.5 
 
 		 208 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  25.6 
 
 		 176 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  29.63 
 
 		 179 aa  41.6  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  24.44 
 
 		 504 aa  41.6  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  29.05 
 
 		 179 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  30.7 
 
 		 198 aa  41.2  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  32 
 
 		 479 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  38.81 
 
 		 189 aa  41.2  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  19.74 
 
 		 231 aa  40.8  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  28.37 
 
 		 180 aa  40.4  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>