94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_05910 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  100 
 
 		 203 aa  413  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  59.88 
 
 		 170 aa  216  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  49.4 
 
 		 185 aa  166  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  46.34 
 
 		 172 aa  154  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  45.73 
 
 		 172 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  45.73 
 
 		 172 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  47.59 
 
 		 181 aa  147  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  47.27 
 
 		 172 aa  143  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  44.83 
 
 		 172 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  39.39 
 
 		 175 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  36.14 
 
 		 166 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  35.71 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  31.68 
 
 		 479 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  35.03 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  32.96 
 
 		 189 aa  100  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  34.97 
 
 		 180 aa  99  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  31.72 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.68 
 
 		 174 aa  92.8  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  32 
 
 		 169 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  31.74 
 
 		 167 aa  91.7  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  38.51 
 
 		 166 aa  89.4  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  47.56 
 
 		 179 aa  88.2  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  36.9 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  27.05 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  31.51 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  27.68 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  27.37 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  26.81 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  34.69 
 
 		 514 aa  58.2  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  26.83 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  29.41 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.42 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  26.89 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  28.08 
 
 		 229 aa  53.9  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  31.58 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  30.61 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  30.89 
 
 		 283 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  36 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  29.59 
 
 		 504 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  25.64 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  28.26 
 
 		 165 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  30.89 
 
 		 291 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  32.22 
 
 		 146 aa  50.4  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  36.84 
 
 		 126 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  27 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  24 
 
 		 155 aa  49.7  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  35.87 
 
 		 483 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  25.17 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  26.53 
 
 		 513 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  27.43 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  23.18 
 
 		 153 aa  48.1  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  25.95 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  33.02 
 
 		 643 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  27.69 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  31.31 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  26.15 
 
 		 561 aa  46.2  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  27.16 
 
 		 255 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  27.59 
 
 		 173 aa  45.8  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  29.85 
 
 		 232 aa  45.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  31.43 
 
 		 172 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  31.03 
 
 		 550 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 		 165 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  26.47 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  32.2 
 
 		 176 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.45 
 
 		 512 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 541 aa  44.3  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  23.47 
 
 		 522 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  25.64 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 		 161 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  29.69 
 
 		 167 aa  43.9  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  31.65 
 
 		 172 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  25.64 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  30.68 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  29.76 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  26.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  24.82 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  29.87 
 
 		 480 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  26.74 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  26.74 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  25.93 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  26.74 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  28.3 
 
 		 161 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  35.59 
 
 		 575 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1320  photosynthetic complex assembly protein  27.05 
 
 		 220 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562837  normal  0.156317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  28.37 
 
 		 575 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  31.08 
 
 		 186 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  29.23 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  22.22 
 
 		 165 aa  41.6  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  27.01 
 
 		 449 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  30.88 
 
 		 554 aa  41.2  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  28.77 
 
 		 501 aa  41.2  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>