19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0154 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  100 
 
 		 216 aa  441  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3541  putative photosynthetic complex assembly protein  54.19 
 
 		 225 aa  224  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1935  hypothetical protein  47.03 
 
 		 214 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0292  hypothetical protein  46.53 
 
 		 214 aa  182  3e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1003  hypothetical protein  47.24 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2035  photosynthetic complex assembly protein  42.03 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1630  hypothetical protein  42.11 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0616  photosynthetic complex assembly protein  38.6 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17866  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3729  putative photosynthetic complex assembly protein  37.98 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1737  putative photosynthetic complex assembly protein  41.49 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3974  photosynthetic complex assembly protein  39.34 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728012  normal  0.262812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1320  photosynthetic complex assembly protein  37.78 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562837  normal  0.156317 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6410  hypothetical protein  39.66 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4809  putative photosynthetic complex assembly protein  33.63 
 
 		 234 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5276  putative photosynthetic complex assembly protein  36.02 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1841  putative photosynthetic complex assembly protein  37.63 
 
 		 216 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0719719 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5354  putative photosynthetic complex assembly protein  35.26 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.457563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3725  putative photosynthetic complex assembly protein  34.57 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  29.77 
 
 		 161 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>