20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3729 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3729  putative photosynthetic complex assembly protein  100 
 
 		 220 aa  443  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3974  photosynthetic complex assembly protein  86.36 
 
 		 220 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728012  normal  0.262812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1737  putative photosynthetic complex assembly protein  78.64 
 
 		 220 aa  345  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1320  photosynthetic complex assembly protein  60.91 
 
 		 220 aa  278  4e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562837  normal  0.156317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0616  photosynthetic complex assembly protein  40.59 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17866  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4809  putative photosynthetic complex assembly protein  42.79 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6410  hypothetical protein  43.63 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2035  photosynthetic complex assembly protein  40.62 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5276  putative photosynthetic complex assembly protein  41.87 
 
 		 238 aa  150  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5354  putative photosynthetic complex assembly protein  43.59 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.457563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1841  putative photosynthetic complex assembly protein  44.68 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0719719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  38.16 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1630  hypothetical protein  37.22 
 
 		 212 aa  137  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1003  hypothetical protein  37.09 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1935  hypothetical protein  37.32 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0292  hypothetical protein  36.36 
 
 		 214 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3725  putative photosynthetic complex assembly protein  43.59 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3541  putative photosynthetic complex assembly protein  37.91 
 
 		 225 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  34.75 
 
 		 170 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  27.48 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>