18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6410 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6410  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  421  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0616  photosynthetic complex assembly protein  48.57 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17866  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1737  putative photosynthetic complex assembly protein  46.45 
 
 		 220 aa  168  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3974  photosynthetic complex assembly protein  44.12 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728012  normal  0.262812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3729  putative photosynthetic complex assembly protein  43.63 
 
 		 220 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1320  photosynthetic complex assembly protein  43.09 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562837  normal  0.156317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5354  putative photosynthetic complex assembly protein  49.09 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.457563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2035  photosynthetic complex assembly protein  42.7 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4809  putative photosynthetic complex assembly protein  47.27 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5276  putative photosynthetic complex assembly protein  46.67 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1841  putative photosynthetic complex assembly protein  51.11 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0719719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  39.08 
 
 		 216 aa  131  6e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1630  hypothetical protein  40 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3541  putative photosynthetic complex assembly protein  38.98 
 
 		 225 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3725  putative photosynthetic complex assembly protein  45.96 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0292  hypothetical protein  40.94 
 
 		 214 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1935  hypothetical protein  40.94 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1003  hypothetical protein  41.52 
 
 		 212 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>