19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3725 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3725  putative photosynthetic complex assembly protein  100 
 
 		 223 aa  407  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0514365 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1841  putative photosynthetic complex assembly protein  56.65 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0719719 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4809  putative photosynthetic complex assembly protein  53.64 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0799721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5276  putative photosynthetic complex assembly protein  50.67 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5354  putative photosynthetic complex assembly protein  56.21 
 
 		 227 aa  161  7e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.457563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0616  photosynthetic complex assembly protein  47.87 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.17866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1630  hypothetical protein  48.65 
 
 		 212 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3974  photosynthetic complex assembly protein  44.32 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0728012  normal  0.262812 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1737  putative photosynthetic complex assembly protein  45.99 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1320  photosynthetic complex assembly protein  42.78 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.562837  normal  0.156317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3729  putative photosynthetic complex assembly protein  43.24 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00156993  hitchhiker  0.00368888 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2035  photosynthetic complex assembly protein  42.21 
 
 		 232 aa  148  7e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1935  hypothetical protein  45.77 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0292  hypothetical protein  45.27 
 
 		 214 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.588521  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3541  putative photosynthetic complex assembly protein  37.76 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6410  hypothetical protein  44.89 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1003  hypothetical protein  41.44 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792862 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0154  photosynthetic complex assembly protein  40 
 
 		 216 aa  121  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  29.2 
 
 		 185 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>