39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2926 on replicon NC_012028
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2927  membrane-flanked domain protein  34.55 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  34.88 
 
 		 173 aa  97.4  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  32.68 
 
 		 170 aa  91.7  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  31.53 
 
 		 166 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  25.89 
 
 		 146 aa  52  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  28.87 
 
 		 219 aa  52  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  30.28 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  29.87 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  22.37 
 
 		 161 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  32.35 
 
 		 574 aa  49.3  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  26.17 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  22.77 
 
 		 479 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4994  hypothetical protein  26.32 
 
 		 1510 aa  48.5  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238076  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  27.91 
 
 		 555 aa  48.5  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  25.44 
 
 		 176 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  23.9 
 
 		 181 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  26.9 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06101  hypothetical protein  28.12 
 
 		 135 aa  46.6  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.211711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3697  membrane-flanked domain-containing protein  28.95 
 
 		 174 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505338  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  32.11 
 
 		 504 aa  46.2  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  23.08 
 
 		 512 aa  45.8  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  32.11 
 
 		 167 aa  45.4  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0804  hypothetical protein  27.48 
 
 		 136 aa  45.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.545184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0948  membrane-flanked domain-containing protein  24.79 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  24.24 
 
 		 530 aa  44.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16591  hypothetical protein  27.48 
 
 		 136 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.802517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  25.56 
 
 		 127 aa  42.7  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  25.32 
 
 		 203 aa  42.7  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  22.86 
 
 		 169 aa  42.4  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 632 aa  42.4  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  27.03 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  23.36 
 
 		 245 aa  42  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  23.2 
 
 		 198 aa  42.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  25 
 
 		 501 aa  41.6  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  28.67 
 
 		 176 aa  42  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0863  hypothetical protein  27.14 
 
 		 554 aa  41.6  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000684677 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  28.03 
 
 		 579 aa  41.6  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0323  hypothetical protein  35.09 
 
 		 495 aa  41.6  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0975839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>