20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0162 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  258  2e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2354  membrane-flanked domain protein  44.86 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  33.75 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  28.24 
 
 		 170 aa  50.8  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  27.36 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  27.37 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  27.1 
 
 		 198 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  31.46 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  26.5 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2015  hypothetical protein  24.35 
 
 		 161 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279675 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  31.25 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  28.71 
 
 		 479 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  22.4 
 
 		 208 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3759  hypothetical protein  22.22 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  24.51 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  20.93 
 
 		 227 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  29.87 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  28.43 
 
 		 153 aa  40.8  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  27.37 
 
 		 181 aa  40  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>