45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7601 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  316  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0473  membrane-flanked domain-containing protein  73.55 
 
 		 155 aa  218  3e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.325345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  64.74 
 
 		 158 aa  214  4e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  45.03 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  35.85 
 
 		 175 aa  100  7e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  35.85 
 
 		 180 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  38.26 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  36.24 
 
 		 172 aa  95.9  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  35.76 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  36.08 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0188  hypothetical protein  36.91 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.167897 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  31.33 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  31.33 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  28.17 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  28.17 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  34.67 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  25.75 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  30.26 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  26.8 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  29.94 
 
 		 479 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1171  membrane-flanked domain-containing protein  28.29 
 
 		 289 aa  53.9  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  25.17 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  29.66 
 
 		 252 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  29.33 
 
 		 169 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  24.62 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  30.21 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  23.53 
 
 		 185 aa  47.8  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  28.57 
 
 		 245 aa  47  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  27.34 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2125  hypothetical protein  23.85 
 
 		 179 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  29.58 
 
 		 575 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  35.59 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  24.16 
 
 		 170 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  31.43 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  36.76 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  31.25 
 
 		 176 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  26.56 
 
 		 176 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  29.69 
 
 		 173 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  25.17 
 
 		 181 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  28.78 
 
 		 291 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  30.77 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 		 198 aa  40.8  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  26.71 
 
 		 371 aa  40.8  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>