110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0225 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
181 aa  348  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  46.91 
 
 
169 aa  120  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  45.96 
 
 
159 aa  115  3e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  44.44 
 
 
161 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  38.51 
 
 
193 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  42.59 
 
 
177 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  39.88 
 
 
186 aa  107  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  37.36 
 
 
170 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  44.77 
 
 
165 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  43.03 
 
 
165 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  43.03 
 
 
165 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  43.03 
 
 
165 aa  102  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  42.44 
 
 
165 aa  101  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  43.21 
 
 
160 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  41.76 
 
 
172 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  44.65 
 
 
160 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  41.51 
 
 
177 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  37.79 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  40.85 
 
 
174 aa  95.9  3e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  37.89 
 
 
164 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  45.13 
 
 
164 aa  91.7  5e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  45.45 
 
 
174 aa  90.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  51.65 
 
 
168 aa  88.2  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  40.94 
 
 
167 aa  88.2  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  44.12 
 
 
196 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  53.57 
 
 
164 aa  82.8  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  39.56 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  34.29 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  27.46 
 
 
162 aa  59.3  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  30.19 
 
 
160 aa  55.8  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  44.57 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  39.53 
 
 
161 aa  53.9  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  34.51 
 
 
153 aa  53.9  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  32.64 
 
 
175 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  41.89 
 
 
148 aa  51.6  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  23.35 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  26.32 
 
 
163 aa  50.1  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  35.56 
 
 
180 aa  49.7  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  27.46 
 
 
163 aa  48.9  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  42.62 
 
 
550 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  41.77 
 
 
483 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  32.71 
 
 
174 aa  48.1  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  34.12 
 
 
632 aa  48.1  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  32.93 
 
 
153 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  29.2 
 
 
530 aa  48.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  39.47 
 
 
188 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  33.64 
 
 
165 aa  47.8  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  32 
 
 
549 aa  47.8  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  34.88 
 
 
161 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  34.52 
 
 
171 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  34.38 
 
 
646 aa  47.4  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
575 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  26.98 
 
 
159 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  31.46 
 
 
547 aa  46.6  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  39.19 
 
 
183 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  36.25 
 
 
491 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  34.62 
 
 
152 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  23.97 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  35.48 
 
 
555 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  32.22 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  23.97 
 
 
158 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  29.65 
 
 
673 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  31.18 
 
 
162 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  31.4 
 
 
155 aa  45.4  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  23.97 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  34.94 
 
 
171 aa  45.1  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  32.53 
 
 
558 aa  45.1  0.0006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  43.55 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  29.27 
 
 
486 aa  44.7  0.0008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 
191 aa  44.3  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  33 
 
 
579 aa  44.7  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  23.29 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  31.18 
 
 
554 aa  43.9  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  23.29 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  42.47 
 
 
182 aa  43.5  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  27.5 
 
 
504 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  38.24 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21820  hypothetical protein  35.79 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  30.23 
 
 
203 aa  44.3  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  35.23 
 
 
153 aa  44.3  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  38.03 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  24.67 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  24.67 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  31.25 
 
 
498 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  28.09 
 
 
634 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  23.29 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  24.67 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  28.74 
 
 
521 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 
178 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  30.08 
 
 
575 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  20.88 
 
 
169 aa  42  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  24.29 
 
 
158 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  24.17 
 
 
512 aa  42  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  24.75 
 
 
181 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  23.08 
 
 
158 aa  41.6  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  22.6 
 
 
158 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  23.08 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  23.08 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  23.08 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  23.08 
 
 
158 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>