96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04063 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  100 
 
 		 501 aa  991    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  56.57 
 
 		 512 aa  459  9.999999999999999e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  25.64 
 
 		 480 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.9 
 
 		 632 aa  111  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.97 
 
 		 549 aa  108  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  23.96 
 
 		 486 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  24.03 
 
 		 504 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  25.94 
 
 		 547 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  24.49 
 
 		 504 aa  93.6  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  20.15 
 
 		 541 aa  91.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  28.27 
 
 		 494 aa  90.1  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  24.4 
 
 		 561 aa  86.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  24.05 
 
 		 493 aa  84  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  29.9 
 
 		 550 aa  77.8  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  24.41 
 
 		 492 aa  77  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  22.02 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  26.43 
 
 		 575 aa  75.9  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  22.26 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  22.32 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  22.26 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  28.76 
 
 		 643 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  27.3 
 
 		 554 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  29.43 
 
 		 483 aa  72.4  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  20.38 
 
 		 514 aa  72  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  28.1 
 
 		 646 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  22.74 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  21.99 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  21.96 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  21.99 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  24.8 
 
 		 443 aa  69.7  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.15 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  21.83 
 
 		 542 aa  69.3  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  16.84 
 
 		 501 aa  69.3  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  28.47 
 
 		 498 aa  68.6  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  23.6 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  23.36 
 
 		 522 aa  67  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  25.54 
 
 		 449 aa  67  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  28.45 
 
 		 476 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  21.66 
 
 		 513 aa  65.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  27.02 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  26.42 
 
 		 575 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  26.47 
 
 		 488 aa  65.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  21.93 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  35.86 
 
 		 579 aa  64.7  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.88 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  23.03 
 
 		 506 aa  63.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  26.83 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  28.8 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  28.27 
 
 		 487 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  27.65 
 
 		 511 aa  60.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  24.79 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  23.52 
 
 		 527 aa  58.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  29.43 
 
 		 504 aa  58.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  23.91 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  26.6 
 
 		 501 aa  57  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  29.45 
 
 		 483 aa  57  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.35 
 
 		 479 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  28.47 
 
 		 533 aa  55.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  32.26 
 
 		 508 aa  55.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  26.1 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  26.1 
 
 		 486 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  23.62 
 
 		 551 aa  54.3  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  19.35 
 
 		 495 aa  53.9  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  23.64 
 
 		 530 aa  53.9  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  26.1 
 
 		 474 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  26.3 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  32.61 
 
 		 195 aa  52.8  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  27.55 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  29.9 
 
 		 153 aa  51.2  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.61 
 
 		 486 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  34.52 
 
 		 155 aa  50.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  20 
 
 		 476 aa  50.4  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  32.26 
 
 		 554 aa  50.1  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  23.79 
 
 		 619 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  36.67 
 
 		 587 aa  48.9  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1083  membrane protein-like protein  23.33 
 
 		 515 aa  49.3  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.76486  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30.25 
 
 		 673 aa  48.9  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.57 
 
 		 480 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.56 
 
 		 470 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  21.94 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  32.56 
 
 		 163 aa  47.8  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  24.92 
 
 		 544 aa  48.1  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  32.26 
 
 		 177 aa  47.8  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  22.55 
 
 		 609 aa  47.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.45 
 
 		 474 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  21.18 
 
 		 474 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  30.95 
 
 		 166 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  32.56 
 
 		 162 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  37.66 
 
 		 491 aa  45.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  29.01 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  31.25 
 
 		 539 aa  44.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  24.14 
 
 		 532 aa  44.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  29.13 
 
 		 658 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  29.9 
 
 		 180 aa  43.9  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  32.95 
 
 		 193 aa  43.5  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  26.14 
 
 		 161 aa  43.5  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>