72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1686 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  100 
 
 		 501 aa  1013    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  46.11 
 
 		 527 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  46.11 
 
 		 527 aa  449  1e-125  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  23.41 
 
 		 480 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  24.94 
 
 		 493 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  26.23 
 
 		 480 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  25.49 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  25.63 
 
 		 486 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  25.05 
 
 		 471 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  24.66 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  25.05 
 
 		 474 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  25.2 
 
 		 474 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  24.65 
 
 		 470 aa  123  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  23.08 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  23.37 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  23.02 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  23.02 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  24.08 
 
 		 476 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  22.62 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  22.92 
 
 		 472 aa  111  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  22.42 
 
 		 472 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  22.38 
 
 		 472 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.42 
 
 		 453 aa  103  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  23.61 
 
 		 471 aa  102  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  24.58 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  23.12 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  18.66 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  23.12 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  21.53 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  20.87 
 
 		 527 aa  72.4  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  16.84 
 
 		 501 aa  72.4  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  22.71 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  20.05 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  22.88 
 
 		 467 aa  68.6  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  20.73 
 
 		 632 aa  67.8  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  20.27 
 
 		 609 aa  65.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  20.33 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  20.32 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  18.65 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  19.16 
 
 		 516 aa  63.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  21.61 
 
 		 551 aa  63.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  21.25 
 
 		 469 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  21.19 
 
 		 506 aa  62.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  20.71 
 
 		 504 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  22.06 
 
 		 513 aa  62  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  20.83 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  21.84 
 
 		 542 aa  58.9  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  20.86 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  20.67 
 
 		 495 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  21.38 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  17.94 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  19.74 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  20.05 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  21.91 
 
 		 514 aa  57  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  20.56 
 
 		 539 aa  54.3  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  18.26 
 
 		 542 aa  53.9  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  20.44 
 
 		 511 aa  53.5  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  19.44 
 
 		 498 aa  53.5  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  17.21 
 
 		 575 aa  53.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  22.67 
 
 		 766 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  18.8 
 
 		 532 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21830  hypothetical protein  18.62 
 
 		 544 aa  51.2  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0642218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  19.21 
 
 		 501 aa  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  22.58 
 
 		 673 aa  50.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0985  hypothetical protein  30.65 
 
 		 114 aa  45.8  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  18.24 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  18.13 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  17.34 
 
 		 549 aa  45.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 		 579 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  22.11 
 
 		 658 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  17.98 
 
 		 533 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  15.55 
 
 		 530 aa  43.5  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>