102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1063 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1063  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 516 aa  983    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  41.79 
 
 		 609 aa  336  7.999999999999999e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  43.2 
 
 		 527 aa  294  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  43.24 
 
 		 504 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  41.73 
 
 		 491 aa  274  3e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  39.11 
 
 		 554 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  45.22 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  41.81 
 
 		 519 aa  259  1e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11250  hypothetical protein  42.3 
 
 		 487 aa  258  2e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473209  hitchhiker  0.00694941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  37.44 
 
 		 634 aa  249  7e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  41.6 
 
 		 501 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0589  membrane-flanked domain-containing protein  38.27 
 
 		 486 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  37.42 
 
 		 486 aa  230  6e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  39.28 
 
 		 483 aa  227  3e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  37.1 
 
 		 474 aa  224  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  38.77 
 
 		 480 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  35.86 
 
 		 554 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  37.47 
 
 		 507 aa  213  4.9999999999999996e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2081  membrane-flanked domain protein  35.85 
 
 		 540 aa  213  5.999999999999999e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0739887  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  40.31 
 
 		 488 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  34.75 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  33.53 
 
 		 643 aa  200  7e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  38.13 
 
 		 532 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  43.66 
 
 		 658 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  31.55 
 
 		 611 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6784  membrane protein-like protein  35.33 
 
 		 508 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  26.28 
 
 		 476 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  25.98 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  24.67 
 
 		 493 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  24.47 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  23.16 
 
 		 472 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  23.15 
 
 		 472 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  21.32 
 
 		 479 aa  94  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  22.32 
 
 		 471 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  23.63 
 
 		 472 aa  93.6  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  23.37 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  23.37 
 
 		 472 aa  93.2  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  21.46 
 
 		 480 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  22.51 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  24.05 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  22.39 
 
 		 474 aa  91.3  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  21.58 
 
 		 470 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  22.53 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.96 
 
 		 474 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  22.08 
 
 		 486 aa  87.4  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  22.51 
 
 		 471 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  27.33 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.88 
 
 		 486 aa  82  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  22.27 
 
 		 453 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.74 
 
 		 549 aa  79.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  21.4 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  23.49 
 
 		 504 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  28.37 
 
 		 489 aa  71.2  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  27.27 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  26.94 
 
 		 501 aa  68.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  20.98 
 
 		 495 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  26.01 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  25.05 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  19.65 
 
 		 501 aa  67  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  27.14 
 
 		 530 aa  65.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  26.04 
 
 		 512 aa  65.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  26.01 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  25.51 
 
 		 632 aa  63.5  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  21.07 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  25.48 
 
 		 551 aa  62  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  27.9 
 
 		 575 aa  62.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  29.18 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  23.31 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  21.52 
 
 		 542 aa  60.8  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  29.3 
 
 		 443 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  22.7 
 
 		 513 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  22.95 
 
 		 492 aa  57.4  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  24.52 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 575 aa  56.2  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  29.33 
 
 		 469 aa  55.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  29.69 
 
 		 579 aa  53.9  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  30.67 
 
 		 170 aa  53.9  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  25.3 
 
 		 521 aa  53.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  27.62 
 
 		 619 aa  52.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  28.06 
 
 		 491 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  15.84 
 
 		 542 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 171 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  27.56 
 
 		 766 aa  50.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  18.58 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  27.2 
 
 		 195 aa  48.9  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  24.06 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  18.27 
 
 		 472 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  26.67 
 
 		 177 aa  47.8  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  30.1 
 
 		 673 aa  47.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  32.98 
 
 		 163 aa  47.4  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  34.29 
 
 		 587 aa  47.4  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  24.83 
 
 		 522 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  29.92 
 
 		 170 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  26.95 
 
 		 539 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  32.76 
 
 		 558 aa  45.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  35.06 
 
 		 186 aa  45.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 		 555 aa  45.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  21.04 
 
 		 514 aa  43.9  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  20.05 
 
 		 483 aa  43.5  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  31.76 
 
 		 527 aa  43.9  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>