74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1464 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 506 aa  1007    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  25.98 
 
 		 480 aa  136  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  24.63 
 
 		 486 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  24.49 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  26.21 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  24.43 
 
 		 479 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  25.16 
 
 		 474 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  24.31 
 
 		 472 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  26.15 
 
 		 453 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  23.33 
 
 		 472 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  25.46 
 
 		 471 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  23.88 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  23.88 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  24.89 
 
 		 470 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  24.73 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  24.52 
 
 		 472 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  25 
 
 		 472 aa  127  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  25.06 
 
 		 471 aa  123  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  25.97 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  24.06 
 
 		 493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.62 
 
 		 480 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.92 
 
 		 476 aa  118  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  29.81 
 
 		 498 aa  110  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  26.92 
 
 		 377 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.17 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.42 
 
 		 632 aa  82.8  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  21.76 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  21.76 
 
 		 527 aa  76.6  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1490  membrane flanked domain-containing protein  20.47 
 
 		 472 aa  76.6  0.0000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  20.37 
 
 		 472 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  23.28 
 
 		 512 aa  71.6  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  20.59 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  23.96 
 
 		 551 aa  67.8  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.35 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  23.78 
 
 		 501 aa  67  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  27.3 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  28.09 
 
 		 673 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  25.45 
 
 		 521 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  20.86 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  23.75 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  25 
 
 		 609 aa  59.3  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  25.43 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  23.38 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  22.45 
 
 		 619 aa  57  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  21.16 
 
 		 513 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  17.55 
 
 		 542 aa  54.7  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  24.36 
 
 		 483 aa  53.9  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  24.45 
 
 		 646 aa  53.1  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  24.74 
 
 		 766 aa  53.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0149  membrane-flanked domain-containing protein  23.94 
 
 		 483 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.808392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  22.59 
 
 		 491 aa  52  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  19.18 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  25.08 
 
 		 555 aa  51.2  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  23.37 
 
 		 575 aa  50.4  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  25.9 
 
 		 507 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0611  membrane-flanked domain-containing protein  24.51 
 
 		 486 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  23.3 
 
 		 700 aa  49.3  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0755  membrane-flanked domain-containing protein  23.6 
 
 		 480 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  24.75 
 
 		 494 aa  47.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  23.85 
 
 		 449 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  20.85 
 
 		 514 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  22.8 
 
 		 575 aa  46.2  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  27.66 
 
 		 554 aa  47  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0223  membrane-flanked domain-containing protein  24.52 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.346085 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0598  membrane-flanked domain-containing protein  24.01 
 
 		 474 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  29.35 
 
 		 193 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  23.42 
 
 		 443 aa  45.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  23.57 
 
 		 561 aa  44.3  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.49 
 
 		 547 aa  44.3  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2893  membrane-flanked domain protein  29 
 
 		 643 aa  44.3  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.736686  normal  0.545256 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  26.32 
 
 		 172 aa  43.9  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 		 539 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  26.23 
 
 		 522 aa  43.5  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>