123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00240 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  100 
 
 		 673 aa  1365    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  38.61 
 
 		 619 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  31.1 
 
 		 700 aa  282  2e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1140  hypothetical protein  21.28 
 
 		 474 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  21.93 
 
 		 486 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1220  hypothetical protein  25.76 
 
 		 474 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  20.86 
 
 		 480 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0974  hypothetical protein  25 
 
 		 486 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0986  hypothetical protein  25.48 
 
 		 377 aa  97.8  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0977  membrane-flanked domain-containing protein  24.22 
 
 		 479 aa  97.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4214  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 471 aa  94  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.150557 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1091  hypothetical protein  24.79 
 
 		 470 aa  93.6  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  19.7 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0821  membrane-flanked domain-containing protein  22.87 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0983  hypothetical protein  23.71 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1164  hypothetical protein  23.91 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4205  membrane-flanked domain protein  23.38 
 
 		 453 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0981  hypothetical protein  23.6 
 
 		 472 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1227  hypothetical protein  23.29 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1100  membrane-flanked domain protein  22.46 
 
 		 471 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.691492  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  26.89 
 
 		 632 aa  79.3  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0996  hypothetical protein  23.91 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1066  hypothetical protein  23.91 
 
 		 472 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0986  membrane-flanked domain-containing protein  28.43 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1149  hypothetical protein  24.53 
 
 		 472 aa  76.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  22.72 
 
 		 561 aa  72.8  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  29.65 
 
 		 480 aa  68.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  32.11 
 
 		 547 aa  64.3  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3800  membrane-flanked domain protein  35.19 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.149133  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.91 
 
 		 486 aa  63.9  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  34.88 
 
 		 554 aa  62.4  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  29.8 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2821  membrane-flanked domain-containing protein  31.85 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  27.5 
 
 		 609 aa  58.9  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2110  membrane-flanked domain-containing protein  19.79 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.961719  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2148  membrane-flanked domain-containing protein  19.79 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.290456  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  24.06 
 
 		 646 aa  58.9  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.94 
 
 		 579 aa  58.5  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  26.88 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1464  membrane-flanked domain protein  27.66 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.454941  normal  0.217907 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  32.63 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  27.8 
 
 		 501 aa  57  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1686  hypothetical protein  19.15 
 
 		 501 aa  56.2  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  55.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0832  hypothetical protein  19.27 
 
 		 542 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0237094  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  30.4 
 
 		 506 aa  56.2  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  32.74 
 
 		 158 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  56.2  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  55.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  31.86 
 
 		 158 aa  55.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 228 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  30.95 
 
 		 587 aa  54.7  0.000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  29.41 
 
 		 530 aa  54.7  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  30 
 
 		 511 aa  54.3  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 		 476 aa  53.9  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  29.37 
 
 		 658 aa  53.9  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.14 
 
 		 512 aa  53.5  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  35.29 
 
 		 164 aa  53.5  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3582  membrane-flanked domain protein  28.72 
 
 		 507 aa  53.5  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.208237  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  52.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  34.74 
 
 		 163 aa  53.1  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.39 
 
 		 549 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  31.78 
 
 		 165 aa  52  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  31.62 
 
 		 177 aa  52  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25.83 
 
 		 494 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  35.29 
 
 		 498 aa  51.6  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 		 555 aa  51.6  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2252  membrane-flanked domain protein  20.95 
 
 		 634 aa  51.2  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.34022  normal  0.602881 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  32.04 
 
 		 176 aa  51.2  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4358  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 		 443 aa  50.8  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.404296 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  27.78 
 
 		 166 aa  50.8  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  28.42 
 
 		 449 aa  50.4  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1686  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 		 532 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00477785  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3512  membrane-flanked domain-containing protein  28.3 
 
 		 491 aa  49.7  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 504 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0804  membrane-flanked domain protein  22.9 
 
 		 495 aa  49.7  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  30.1 
 
 		 183 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  28.3 
 
 		 192 aa  48.9  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  25.91 
 
 		 203 aa  48.5  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  23.38 
 
 		 177 aa  48.5  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2002  hypothetical protein  21.56 
 
 		 483 aa  48.1  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  22.39 
 
 		 492 aa  48.1  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  23.85 
 
 		 195 aa  48.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  30.68 
 
 		 504 aa  48.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 		 159 aa  47.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1761  hypothetical protein  19.1 
 
 		 472 aa  47.8  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0268968  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0624  membrane-flanked domain-containing protein  30.53 
 
 		 312 aa  47.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.614646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 		 555 aa  47.4  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  34.21 
 
 		 161 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  28.74 
 
 		 184 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  29.11 
 
 		 174 aa  47.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  27.72 
 
 		 177 aa  46.6  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  29.31 
 
 		 169 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  24.07 
 
 		 158 aa  46.6  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  30.38 
 
 		 539 aa  47  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  34.07 
 
 		 171 aa  47  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>