128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23370 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  100 
 
 
164 aa  325  1.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  48.8 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  46.39 
 
 
161 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  47.24 
 
 
177 aa  114  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  43.56 
 
 
169 aa  113  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  46.63 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  41.92 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  41.92 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  41.92 
 
 
165 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  45.4 
 
 
160 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  42.11 
 
 
165 aa  102  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  41.1 
 
 
164 aa  100  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  41.67 
 
 
159 aa  98.2  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  47.5 
 
 
174 aa  98.6  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  42.94 
 
 
160 aa  97.4  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  40.49 
 
 
170 aa  97.1  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  38.51 
 
 
186 aa  95.5  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  38.24 
 
 
193 aa  93.2  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  38.37 
 
 
172 aa  92.8  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  45.13 
 
 
181 aa  90.9  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  52.75 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  36.81 
 
 
166 aa  89  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  35.12 
 
 
174 aa  87.4  8e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  47.52 
 
 
196 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  28.85 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  48.35 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  27.74 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  28.47 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  28.68 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  28.47 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  27.01 
 
 
158 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  40.21 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  27.01 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  27.01 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  27.01 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  27.01 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  25.55 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  33.76 
 
 
159 aa  68.2  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  30.37 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  32.33 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  32.33 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  25.19 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  41.88 
 
 
161 aa  64.7  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  27.87 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  27.64 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  27.87 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  28.46 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  30.95 
 
 
191 aa  63.5  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 
195 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  27.64 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  26.51 
 
 
162 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  30.22 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  30.81 
 
 
163 aa  58.9  0.00000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  32.59 
 
 
183 aa  58.5  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  35.64 
 
 
153 aa  53.9  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  36.67 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  31.9 
 
 
170 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  35.29 
 
 
673 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  37.65 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  31.03 
 
 
163 aa  52.4  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  35.56 
 
 
549 aa  51.2  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  23.33 
 
 
169 aa  51.2  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  32.73 
 
 
512 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  34.88 
 
 
550 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  35.56 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 
203 aa  49.7  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  37.93 
 
 
153 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  29.46 
 
 
155 aa  48.9  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  22.44 
 
 
165 aa  48.1  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  25.32 
 
 
228 aa  48.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.98 
 
 
530 aa  47.8  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  32.97 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  35.9 
 
 
171 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  32.47 
 
 
167 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  33.73 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  28.47 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  34.67 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  30.53 
 
 
182 aa  45.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  44.44 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  32.32 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  32.32 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  32.32 
 
 
179 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  28.89 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  34.38 
 
 
216 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1948  hypothetical protein  29.89 
 
 
554 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.561491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  31.31 
 
 
179 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  37.14 
 
 
182 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  38.33 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  31.78 
 
 
504 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23360  predicted membrane protein  25.27 
 
 
611 aa  45.1  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
165 aa  45.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  33.72 
 
 
491 aa  44.7  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  36.67 
 
 
498 aa  44.3  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  35.9 
 
 
555 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  30.77 
 
 
486 aa  44.3  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>