110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0610 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
165 aa  317  3e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
165 aa  317  3e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 
165 aa  317  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  71.52 
 
 
160 aa  203  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  69.62 
 
 
160 aa  203  9e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  65 
 
 
177 aa  199  9.999999999999999e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  49.69 
 
 
159 aa  130  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  49.69 
 
 
169 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  49.07 
 
 
161 aa  128  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  50.31 
 
 
165 aa  127  6e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  48.78 
 
 
164 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  55.83 
 
 
174 aa  123  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  49.38 
 
 
165 aa  122  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  44.17 
 
 
166 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  47.27 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  45.62 
 
 
174 aa  111  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  41.92 
 
 
164 aa  107  7.000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  56.84 
 
 
170 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  56.7 
 
 
168 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  52.1 
 
 
196 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  50.94 
 
 
181 aa  97.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  45.13 
 
 
186 aa  96.7  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  50.52 
 
 
164 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  44.44 
 
 
193 aa  87.4  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  37.5 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  44.21 
 
 
167 aa  79  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  41.06 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  28.15 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  39.04 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  36.7 
 
 
180 aa  61.2  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  36.18 
 
 
159 aa  61.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  25.38 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  25.38 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  25.38 
 
 
158 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  31.1 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  31.87 
 
 
162 aa  58.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  24.62 
 
 
158 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  40.66 
 
 
153 aa  57.4  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  30.77 
 
 
163 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  24.81 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  42.31 
 
 
161 aa  55.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  23.85 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  23.85 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  32.65 
 
 
195 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  23.85 
 
 
158 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  31.79 
 
 
160 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  23.85 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  23.85 
 
 
158 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  41.11 
 
 
153 aa  54.7  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  35.9 
 
 
203 aa  54.3  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  24.32 
 
 
169 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  30.68 
 
 
512 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  36.59 
 
 
550 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  31.31 
 
 
159 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  42.37 
 
 
152 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  29.89 
 
 
163 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  30.84 
 
 
191 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  23.7 
 
 
158 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  30.63 
 
 
498 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  30.53 
 
 
176 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  25.19 
 
 
158 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  23.7 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  23.7 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  23.7 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  39.32 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  23.7 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  23.7 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  23.7 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  21.37 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  36.92 
 
 
190 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  37.04 
 
 
184 aa  48.1  0.00005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  24.44 
 
 
158 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  36.47 
 
 
555 aa  45.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  32.47 
 
 
182 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  28.21 
 
 
203 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  33.87 
 
 
549 aa  45.8  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  23.38 
 
 
159 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  38.46 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  28.07 
 
 
561 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  36.47 
 
 
555 aa  45.4  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  32.53 
 
 
700 aa  45.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  32.43 
 
 
530 aa  44.3  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2111  hypothetical protein  24.14 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.996878  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2149  hypothetical protein  24.14 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.325294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  34.21 
 
 
491 aa  43.9  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  27.91 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  24.22 
 
 
242 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  27.88 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  47.62 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  28.57 
 
 
673 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  36.11 
 
 
165 aa  43.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  34.07 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  38.89 
 
 
501 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
547 aa  42.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  29.91 
 
 
179 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  29.91 
 
 
179 aa  42  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0321  membrane-flanked domain protein  31.9 
 
 
521 aa  41.6  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 
575 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>