116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2251 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  100 
 
 
165 aa  320  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  64.38 
 
 
164 aa  187  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  58.28 
 
 
169 aa  184  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  60.13 
 
 
196 aa  181  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  59.75 
 
 
161 aa  177  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  61.59 
 
 
174 aa  167  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  57.32 
 
 
168 aa  157  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  56.96 
 
 
164 aa  150  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  49.37 
 
 
170 aa  150  8.999999999999999e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  51.55 
 
 
159 aa  137  6e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  50.62 
 
 
165 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  50.31 
 
 
165 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  50.31 
 
 
165 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  50.31 
 
 
165 aa  127  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  47.5 
 
 
166 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  47.17 
 
 
177 aa  123  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  65.26 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  43.27 
 
 
186 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  62.11 
 
 
160 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  58.76 
 
 
177 aa  114  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  43.48 
 
 
174 aa  110  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  40.7 
 
 
193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  42.11 
 
 
164 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  37.79 
 
 
172 aa  98.2  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  47.06 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  48.42 
 
 
167 aa  84.3  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  35.53 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  31.45 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  34.57 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  28.89 
 
 
159 aa  61.6  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 
161 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  38.05 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  34.62 
 
 
163 aa  58.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  42.17 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  22.79 
 
 
169 aa  56.2  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  41.18 
 
 
184 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  33.9 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  37.04 
 
 
180 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  25 
 
 
158 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 
165 aa  54.7  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  28.1 
 
 
152 aa  54.3  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  32.65 
 
 
195 aa  53.9  0.0000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  37.78 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  31.76 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  30 
 
 
170 aa  51.6  0.000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  35.92 
 
 
183 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  36.36 
 
 
153 aa  52  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  24.49 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  40.51 
 
 
550 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
658 aa  50.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  36.62 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  27.93 
 
 
191 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  26.39 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  42.86 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  42.86 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  32.61 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  30.08 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  32.67 
 
 
203 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
549 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  34.88 
 
 
161 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  30.99 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  30.99 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  26.67 
 
 
162 aa  48.1  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21820  hypothetical protein  35.71 
 
 
191 aa  48.1  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.209631  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  37.11 
 
 
519 aa  48.1  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  33.75 
 
 
491 aa  47.8  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  25 
 
 
158 aa  47.8  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  21.88 
 
 
158 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  27.18 
 
 
155 aa  47  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  32.71 
 
 
183 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  21.88 
 
 
158 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  21.88 
 
 
158 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  30.97 
 
 
558 aa  47.4  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  32.77 
 
 
160 aa  47.4  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  24.11 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  24.11 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  24.11 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  24.11 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  22 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  24.11 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  32.5 
 
 
555 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  27.2 
 
 
207 aa  45.4  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  33.73 
 
 
632 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  34.78 
 
 
167 aa  45.1  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  38.03 
 
 
176 aa  44.3  0.0007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  36.11 
 
 
646 aa  44.3  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  23.85 
 
 
158 aa  44.3  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  32.14 
 
 
171 aa  44.3  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.55 
 
 
512 aa  44.3  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  32.5 
 
 
555 aa  44.3  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  26.47 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  25.88 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  25.88 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  25.88 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  28.05 
 
 
170 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  36.71 
 
 
498 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  28.24 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  25.88 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  25.88 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  25.88 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>