91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3702 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  69.41 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  57.76 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  43.32 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  43.3 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  43.48 
 
 		 176 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  41.67 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  29.34 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  27.95 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  29.93 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  33.71 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  37.97 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  28.3 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  28.85 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  31.19 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  35.63 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  31.48 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  29.77 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  36.59 
 
 		 163 aa  58.2  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  37.04 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  33.75 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  30.07 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  32.69 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  36.9 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  30.38 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  29.91 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  29.7 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  35.8 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  31.46 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  31.46 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  26.87 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  31.46 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  26.87 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  38.27 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  31.46 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  31.46 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  30.68 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  31.46 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  26.12 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  28.26 
 
 		 158 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  36.71 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  36.71 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  31.46 
 
 		 158 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  25.3 
 
 		 673 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  32.58 
 
 		 158 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  25.66 
 
 		 159 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  30.09 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  32.58 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  24.82 
 
 		 192 aa  50.8  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  35.29 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  30.77 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  28.81 
 
 		 160 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  30.43 
 
 		 191 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  25.32 
 
 		 164 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  29.41 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  28.97 
 
 		 161 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  30.17 
 
 		 177 aa  47.4  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  20.96 
 
 		 549 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  26.8 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  24 
 
 		 547 aa  45.8  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  25.56 
 
 		 163 aa  45.4  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  26.89 
 
 		 558 aa  45.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  25.15 
 
 		 504 aa  44.7  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  27.55 
 
 		 700 aa  44.7  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  26.32 
 
 		 541 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  31.25 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  23.08 
 
 		 579 aa  43.9  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  30.49 
 
 		 587 aa  43.5  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  23.85 
 
 		 449 aa  43.1  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  30.84 
 
 		 530 aa  42.7  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  29.55 
 
 		 493 aa  42.7  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  27.37 
 
 		 619 aa  42.7  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  29.81 
 
 		 476 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  32.79 
 
 		 555 aa  42.4  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  27.85 
 
 		 155 aa  42  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01310  predicted membrane protein  28.36 
 
 		 561 aa  42  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  27.55 
 
 		 575 aa  42  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 		 162 aa  42  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1151  membrane-flanked domain-containing protein  26.76 
 
 		 533 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0624  membrane-flanked domain-containing protein  29.82 
 
 		 312 aa  41.6  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.614646  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>