110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3576 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  100 
 
 
182 aa  347  8e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  48.13 
 
 
180 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  38.76 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  39.16 
 
 
153 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  35.59 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  41.49 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  30.95 
 
 
242 aa  63.9  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  42.11 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  42.31 
 
 
153 aa  62.8  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  36.54 
 
 
203 aa  62.4  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  35.62 
 
 
183 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  39.32 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  38.37 
 
 
176 aa  57.8  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  39.32 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  39.32 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  33.33 
 
 
170 aa  56.6  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  37.35 
 
 
199 aa  54.7  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  33.91 
 
 
165 aa  54.7  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  32.39 
 
 
160 aa  54.3  0.0000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  41.38 
 
 
159 aa  54.3  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0548  membrane-flanked domain  37.18 
 
 
491 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.329035 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  30.83 
 
 
158 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  40.26 
 
 
168 aa  53.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  26.47 
 
 
180 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  31.01 
 
 
207 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 
165 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  25.3 
 
 
165 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  37.21 
 
 
171 aa  52  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  26.47 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  26.47 
 
 
180 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  25.33 
 
 
152 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  27.34 
 
 
176 aa  51.6  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 
242 aa  51.6  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  30.23 
 
 
228 aa  51.2  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  26.54 
 
 
541 aa  51.2  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  30.23 
 
 
216 aa  51.2  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  27.73 
 
 
158 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  30.51 
 
 
167 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  35.63 
 
 
184 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  28.69 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  32.12 
 
 
646 aa  50.1  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  26.92 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 
179 aa  49.7  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  36.71 
 
 
163 aa  49.3  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  27.82 
 
 
549 aa  49.3  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  25.6 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  25.6 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  25.6 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  26.15 
 
 
179 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  29.21 
 
 
513 aa  48.9  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  25.6 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  25.6 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  25.6 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  28.76 
 
 
170 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  31.65 
 
 
161 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  30.95 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  30.95 
 
 
163 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  45.45 
 
 
183 aa  48.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  28 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  43.06 
 
 
160 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  31.79 
 
 
190 aa  47.8  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0731  hypothetical protein  31.65 
 
 
165 aa  47.8  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  31.91 
 
 
575 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  35.44 
 
 
162 aa  47.8  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  35.82 
 
 
165 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  29.9 
 
 
547 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  25.62 
 
 
158 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  26.45 
 
 
158 aa  47  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  25.62 
 
 
158 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  37.31 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  28.21 
 
 
522 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  37.66 
 
 
177 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  33.67 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.84 
 
 
579 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  33.94 
 
 
186 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  43.28 
 
 
182 aa  45.1  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  35 
 
 
555 aa  45.4  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  38.96 
 
 
160 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  30.77 
 
 
174 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  30.43 
 
 
164 aa  45.1  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  49.09 
 
 
182 aa  44.7  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  34.78 
 
 
174 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  25.96 
 
 
504 aa  44.3  0.0009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  29.76 
 
 
195 aa  43.9  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  33.68 
 
 
164 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  22.37 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  37.11 
 
 
172 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  33.77 
 
 
193 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  38.46 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>