149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14490 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  325  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  63.35 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  57.58 
 
 		 165 aa  174  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  60 
 
 		 196 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  55.49 
 
 		 169 aa  159  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  56.55 
 
 		 164 aa  158  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  55.28 
 
 		 161 aa  155  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  56.95 
 
 		 174 aa  154  7e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  52.98 
 
 		 170 aa  153  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  47.83 
 
 		 159 aa  124  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  48.77 
 
 		 165 aa  120  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  47.56 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  50.38 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  50.38 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  50.38 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  42.41 
 
 		 166 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  55.2 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  57.73 
 
 		 177 aa  105  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  57.89 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  38.24 
 
 		 172 aa  99  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  37.79 
 
 		 186 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  42.17 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  37.29 
 
 		 193 aa  96.3  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  37.28 
 
 		 174 aa  93.6  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  51.65 
 
 		 181 aa  87.8  6e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  50.53 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  37.97 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  32.89 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  36.96 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  32.19 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  31.82 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  35.11 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  43.42 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  39.53 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0800  membrane protein-like protein  33.88 
 
 		 550 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  29.03 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  45.07 
 
 		 182 aa  57.4  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  34.15 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  25 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  43.66 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  32.99 
 
 		 512 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  29.69 
 
 		 646 aa  55.1  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  43.1 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  34.4 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  38.27 
 
 		 171 aa  53.5  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  42.65 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  37.97 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  26.73 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  34.31 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  36.84 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  35.82 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2832  membrane-flanked domain protein  39.29 
 
 		 658 aa  52.4  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.578918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  30.69 
 
 		 549 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1331  membrane-flanked domain protein  31.78 
 
 		 511 aa  52  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.280277  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  27.72 
 
 		 191 aa  51.6  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  31.88 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  38.03 
 
 		 150 aa  51.6  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  38.75 
 
 		 170 aa  51.6  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  38.71 
 
 		 555 aa  50.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 		 192 aa  50.8  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  25.19 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  25.19 
 
 		 163 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  24.84 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  29.17 
 
 		 203 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  39.24 
 
 		 161 aa  49.3  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  43.94 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  33.93 
 
 		 174 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  34.21 
 
 		 632 aa  48.9  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  43.75 
 
 		 183 aa  48.5  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  30.33 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  30.33 
 
 		 179 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  30.33 
 
 		 179 aa  47.8  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  35.8 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1687  hypothetical protein  21.15 
 
 		 159 aa  47.8  0.00008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  29.46 
 
 		 242 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  29.46 
 
 		 179 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  26.23 
 
 		 579 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4977  membrane-flanked domain protein  36.23 
 
 		 539 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0396765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  36.08 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  34.92 
 
 		 170 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  32.22 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0633  membrane-flanked domain protein  38.98 
 
 		 555 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.13864  normal  0.33632 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  29.08 
 
 		 219 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  35.78 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  30.59 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  22.36 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  22.36 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  35.9 
 
 		 188 aa  45.8  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  22.36 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  29.6 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  31.94 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  24.56 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>