65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2888 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  369  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  53.38 
 
 		 148 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  46.2 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  44.97 
 
 		 174 aa  101  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  38.75 
 
 		 167 aa  94.4  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  37.82 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  38.46 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  35.95 
 
 		 167 aa  92.4  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  38.99 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  41.48 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  37.84 
 
 		 174 aa  89  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  46.59 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  50 
 
 		 161 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  33.13 
 
 		 170 aa  81.3  0.000000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  50.59 
 
 		 171 aa  80.9  0.000000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  36.24 
 
 		 183 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  40.7 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  34.02 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  35.33 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  30.84 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  35.94 
 
 		 161 aa  53.1  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  30.14 
 
 		 164 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  34.68 
 
 		 153 aa  51.6  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  36.79 
 
 		 193 aa  51.6  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  36.05 
 
 		 575 aa  51.2  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  36 
 
 		 155 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  26.88 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  32.31 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  28.3 
 
 		 512 aa  48.1  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  36.71 
 
 		 153 aa  48.1  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  34.52 
 
 		 700 aa  48.1  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  39.47 
 
 		 181 aa  47.8  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6785  hypothetical protein  39.13 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0853  hypothetical protein  32.22 
 
 		 609 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.052171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14500  predicted membrane protein  31.17 
 
 		 504 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  34.25 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  35.9 
 
 		 168 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  36.71 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  34.01 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  36.36 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  42.59 
 
 		 174 aa  45.1  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0623  membrane-flanked domain-containing protein  35.44 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.959285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  30.69 
 
 		 207 aa  44.7  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  26.61 
 
 		 242 aa  44.7  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  30.86 
 
 		 619 aa  43.9  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  34.96 
 
 		 486 aa  43.9  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2887  hypothetical protein  37.14 
 
 		 766 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  30.22 
 
 		 180 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  29.79 
 
 		 646 aa  43.1  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  35 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  34.62 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  29.14 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 673 aa  43.5  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 476 aa  43.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  31.17 
 
 		 170 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3047  serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 		 504 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  43.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  29.49 
 
 		 152 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0224  membrane-flanked domain protein  29.2 
 
 		 488 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2115  membrane-flanked domain protein  25.79 
 
 		 494 aa  42.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32030  predicted membrane protein  30.72 
 
 		 530 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  35.9 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  33.78 
 
 		 164 aa  41.6  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  22.94 
 
 		 158 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  24.77 
 
 		 158 aa  41.2  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>