151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_12850 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  371  1e-102  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  37.58 
 
 
165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  38.31 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  38.46 
 
 
170 aa  96.7  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  36.36 
 
 
170 aa  94.7  8e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  41.89 
 
 
150 aa  89.7  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  37.16 
 
 
183 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  40.35 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  37.01 
 
 
167 aa  84  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  35.26 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  36.21 
 
 
161 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  41.3 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  32.48 
 
 
167 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  31.33 
 
 
158 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  32.19 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  31.51 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  31.51 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  32.19 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  30.67 
 
 
158 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  31.51 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  31.51 
 
 
158 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  31.51 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  31.51 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  35.48 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  35.16 
 
 
182 aa  67.8  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  32.8 
 
 
158 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  34.68 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  38.46 
 
 
176 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  37.33 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  34.68 
 
 
158 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  31.67 
 
 
171 aa  64.3  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  35.16 
 
 
158 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  38.82 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  33.87 
 
 
158 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  40.23 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  40.23 
 
 
163 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  31.21 
 
 
184 aa  62.4  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  37.65 
 
 
182 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  35.71 
 
 
180 aa  61.6  0.000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  36.63 
 
 
160 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1685  hypothetical protein  36.14 
 
 
169 aa  61.2  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.767945  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  29.93 
 
 
242 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  31.97 
 
 
155 aa  59.3  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  31.76 
 
 
216 aa  58.9  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  40.26 
 
 
199 aa  59.3  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  37.04 
 
 
228 aa  58.5  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  33.68 
 
 
242 aa  58.9  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  36.47 
 
 
170 aa  58.5  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  35.8 
 
 
148 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  34.13 
 
 
555 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  36.56 
 
 
162 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  28.92 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  37.86 
 
 
163 aa  53.9  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  38.46 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  31.76 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
169 aa  53.1  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  31.75 
 
 
160 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1465  membrane-flanked domain protein  30.19 
 
 
191 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279827  normal  0.256215 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  40.38 
 
 
177 aa  52.4  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  30.69 
 
 
512 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  38.36 
 
 
547 aa  52  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  32.93 
 
 
177 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  35.82 
 
 
168 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  40 
 
 
160 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  36.84 
 
 
163 aa  51.6  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  32.88 
 
 
493 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  33.07 
 
 
575 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  29.23 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3310  membrane-flanked domain protein  30.25 
 
 
519 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0193297 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  37.14 
 
 
549 aa  50.1  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  41.1 
 
 
498 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  29.27 
 
 
166 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  30.14 
 
 
161 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  34.18 
 
 
619 aa  49.7  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  29.25 
 
 
174 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  36.92 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  31.54 
 
 
646 aa  48.9  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  36.92 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  36.92 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  24.75 
 
 
480 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2894  membrane-flanked domain protein  26.29 
 
 
193 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  39.06 
 
 
159 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  35 
 
 
489 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  30.69 
 
 
176 aa  48.1  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  30.77 
 
 
153 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  30.86 
 
 
170 aa  46.6  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  29.25 
 
 
196 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  36.78 
 
 
161 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  33.77 
 
 
579 aa  47  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  28.89 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  27.68 
 
 
195 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  34.78 
 
 
174 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>