139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1203 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 161 aa  317  6e-86  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  50 
 
 		 153 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  51.63 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  53.64 
 
 		 203 aa  142  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  53.21 
 
 		 153 aa  138  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  49.02 
 
 		 153 aa  133  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4624  membrane-flanked domain protein  32.12 
 
 		 152 aa  88.6  4e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  39.61 
 
 		 159 aa  87.8  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  42.86 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  36.49 
 
 		 155 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  32.93 
 
 		 160 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  34.16 
 
 		 163 aa  72.8  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  40.22 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  40.45 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  36.36 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  30.38 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  29.56 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  27.21 
 
 		 165 aa  67  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3581  membrane-flanked domain protein  33.97 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.111681  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  28.76 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  30.52 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  30.72 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  29.87 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  29.87 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  30.32 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  30.82 
 
 		 158 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  29.11 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  43.42 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  29.41 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  29.8 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  41.88 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  41.67 
 
 		 184 aa  64.3  0.0000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  43.9 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  29.68 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14490  hypothetical protein  42.35 
 
 		 168 aa  63.9  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  35.59 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  35.1 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1567  hypothetical protein  28.21 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  35.96 
 
 		 632 aa  62  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  41.57 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2820  membrane-flanked domain-containing protein  35.51 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  31.48 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  37.14 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  41.57 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  33.57 
 
 		 549 aa  58.9  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  31.94 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  27.97 
 
 		 579 aa  57.8  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  41.05 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11251  hypothetical protein  40.62 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0863193  hitchhiker  0.00620423 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0799  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  35.26 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  40.51 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 547 aa  57.4  0.00000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0150  membrane-flanked domain-containing protein  41.38 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  36.79 
 
 		 170 aa  57  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  42.31 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  42.31 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  42.31 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  28.57 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0754  membrane-flanked domain-containing protein  40.23 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1064  membrane-flanked domain protein  39.22 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  34.04 
 
 		 174 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1949  hypothetical protein  33.93 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.47797  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2833  membrane-flanked domain protein  36.26 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.460728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  35.62 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2080  membrane-flanked domain protein  36.78 
 
 		 170 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222233  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  32.23 
 
 		 646 aa  53.5  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  30.3 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0225  membrane-flanked domain protein  39.53 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  32.08 
 
 		 486 aa  52.4  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  40 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 165 aa  51.6  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3311  membrane-flanked domain protein  38.82 
 
 		 164 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0274064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  28.46 
 
 		 514 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0854  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.059072 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  31.11 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  34.41 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3799  membrane-flanked domain protein  39.29 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0777752  normal  0.644197 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2979  membrane-flanked domain protein  34.31 
 
 		 555 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0805  membrane-flanked domain protein  24.34 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  37.21 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  38.67 
 
 		 174 aa  47.8  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  28.37 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2098  membrane-flanked domain protein  31.58 
 
 		 558 aa  47.4  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  36.78 
 
 		 190 aa  47  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  25.47 
 
 		 541 aa  46.6  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2526  membrane-flanked domain protein  29.09 
 
 		 480 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>