115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2912 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3702  membrane-flanked domain-containing protein  43.48 
 
 		 228 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.327251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4032  membrane-flanked domain-containing protein  44.1 
 
 		 242 aa  127  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3351  membrane-flanked domain-containing protein  40.74 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0577899  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0941  membrane-flanked domain-containing protein  40.7 
 
 		 242 aa  121  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3091  membrane-flanked domain-containing protein  39.39 
 
 		 207 aa  121  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3048  hypothetical protein  40 
 
 		 170 aa  78.2  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000693301 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1150  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01634  hypothetical protein  31.37 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0320  membrane-flanked domain protein  32.65 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12850  hypothetical protein  38.46 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0949122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0157  membrane-flanked domain-containing protein  40 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.782517  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  30.65 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2525  membrane-flanked domain protein  36.28 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1821  membrane-flanked domain protein  34.96 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0547  membrane-flanked domain  40.45 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.947374  normal  0.257454 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2099  membrane-flanked domain protein  33.03 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.951774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01300  hypothetical protein  30.87 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0632  membrane-flanked domain protein  39.53 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137615  normal  0.276149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0707  membrane-flanked domain protein  35.16 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.675583  normal  0.404527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2980  membrane-flanked domain protein  36.08 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.987717  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1203  membrane-flanked domain protein  31.16 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000301885  hitchhiker  0.00000403438 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0984  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0973  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1054  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1818  membrane-flanked domain protein  30.3 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3576  membrane-flanked domain  46.67 
 
 		 182 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1219  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1090  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4215  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.148232 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1139  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1158  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.223016  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0973  hypothetical protein  35.71 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1819  membrane-flanked domain protein  33.64 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2982  membrane-flanked domain protein  39.77 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0445  membrane-flanked domain-containing protein  35.87 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0976  membrane-flanked domain-containing protein  34.52 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1163  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0980  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0982  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1065  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3596  membrane-flanked domain protein  31.94 
 
 		 646 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.000563429  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3030  membrane-flanked domain-containing protein  32.37 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.62962 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0820  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04064  membrane flanked domain family  33.62 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1148  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4357  membrane-flanked domain-containing protein  39.77 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.351657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0985  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  32.23 
 
 		 512 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.516233  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2115  membrane-flanked domain protein  40.85 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.21509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32040  hypothetical protein  36.47 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  34.62 
 
 		 177 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3597  membrane-flanked domain protein  44.64 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000241745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2491  membrane-flanked domain-containing protein  37.62 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2116  membrane-flanked domain protein  35.62 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4206  hypothetical protein  32.14 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  33.75 
 
 		 549 aa  51.6  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0831  hypothetical protein  30.95 
 
 		 165 aa  51.2  0.000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00137006  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0244  membrane-flanked domain protein  29.05 
 
 		 162 aa  51.2  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  24.46 
 
 		 195 aa  50.8  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3256  membrane-flanked domain-containing protein  38.1 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0355  membrane-flanked domain protein  36 
 
 		 203 aa  50.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432254  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  32.04 
 
 		 673 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1330  membrane-flanked domain protein  32.95 
 
 		 174 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  33.73 
 
 		 467 aa  50.1  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0624  membrane-flanked domain-containing protein  28.45 
 
 		 312 aa  49.3  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.614646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2109  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.445001  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2147  membrane-flanked domain-containing protein  37.5 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01210  hypothetical protein  40.32 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4496  membrane-flanked domain protein  33.66 
 
 		 171 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1760  membrane-flanked domain protein  43.4 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1685  membrane-flanked domain protein  36.78 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000885926  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  28.7 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3031  membrane-flanked domain-containing protein  36.05 
 
 		 476 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.687058 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1820  membrane-flanked domain protein  45.83 
 
 		 579 aa  45.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0224  membrane-flanked domain-containing protein  31.86 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.864964  normal  0.664801 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3257  membrane-flanked domain-containing protein  36.05 
 
 		 489 aa  44.7  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  36.26 
 
 		 169 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  32.43 
 
 		 493 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2251  membrane-flanked domain protein  38.03 
 
 		 165 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.609156  normal  0.459764 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  29.9 
 
 		 486 aa  44.3  0.0009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2888  hypothetical protein  36.71 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  34.15 
 
 		 575 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2003  hypothetical protein  25.49 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3511  membrane-flanked domain-containing protein  37.35 
 
 		 165 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819135  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4976  membrane-flanked domain protein  32.5 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0726163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  35.14 
 
 		 575 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0158  membrane-flanked domain-containing protein  33.73 
 
 		 551 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  29.33 
 
 		 492 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1084  membrane-flanked domain-containing protein  28.85 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.491296  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01635  hypothetical protein  37.5 
 
 		 542 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.381049  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0597  membrane-flanked domain-containing protein  28.4 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0610  membrane-flanked domain-containing protein  28.4 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0588  membrane-flanked domain-containing protein  28.4 
 
 		 165 aa  42.7  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  34.94 
 
 		 632 aa  42.7  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  27.68 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23370  hypothetical protein  42.59 
 
 		 164 aa  42.4  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.415548  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>