25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0515 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0515  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 183 aa  377  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.666487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  34.29 
 
 		 180 aa  106  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  34.29 
 
 		 180 aa  106  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  33.71 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  34.68 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  34.68 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  34.1 
 
 		 179 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  34.1 
 
 		 179 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  35.5 
 
 		 176 aa  100  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  35.82 
 
 		 176 aa  87.8  9e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0836  membrane-flanked domain-containing protein  35.43 
 
 		 179 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.420646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3182  membrane-flanked domain-containing protein  33.94 
 
 		 178 aa  85.9  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  32.57 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1783  membrane-flanked domain protein  23.81 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481798  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1000  hypothetical protein  28 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0241842  normal  0.257315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2114  membrane-flanked domain protein  26.39 
 
 		 549 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.355312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1940  membrane-flanked domain-containing protein  24.26 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2912  hypothetical protein  29.46 
 
 		 176 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  23.66 
 
 		 449 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  27.78 
 
 		 243 aa  45.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3015  membrane-flanked domain-containing protein  26.36 
 
 		 575 aa  45.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146242  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1204  membrane-flanked domain protein  28.95 
 
 		 632 aa  44.7  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000158592  hitchhiker  0.00000893365 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0446  membrane-flanked domain-containing protein  36 
 
 		 498 aa  42  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0624  membrane-flanked domain-containing protein  25.81 
 
 		 312 aa  41.6  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.614646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4625  membrane-flanked domain protein  29.07 
 
 		 467 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>